Publicité
Test Vivalytic Bordetella
• Wynik ujemny nie wyklucza obecności patogenów w próbce w stężeniu
poniżej czułości oznaczenia lub innego patogenu, którego to oznaczenie
nie wykrywa.
• Istnieje ryzyko uzyskania wyników fałszywie ujemnych lub fałszywie
dodatnich z powodu niewłaściwie pobranych, transportowanych lub
przygotowanych próbek.
• W przypadkach granicznych może dojść do uzyskania atypowych charak-
terystyk reakcji PCR (np. płaska krzywa z niską lub wysoką wartością C
W przypadku atypowej charakterystyki nie można używać uzyskanych
wyników do interpretacji diagnostycznej. Zaleca się powtórzenie badania.
• Wynik dodatni nie musi oznaczać obecności żywych patogenów.
• Vivalytic Bordetella jest jakościowym testem bazującym na reakcji PCR
w czasie rzeczywistym, który nie zapewnia wyniku ilościowego.
• Wynik dodatni pod względem sekwencji IS481 i hIS1001 może być spo-
wodowany obecnością w próbce bakterii B. holmesii, jak również bakterii
B. pertussis i B. holmesii.
• Wynik dodatni pod względem sekwencji IS481 można uznać za prawdopod-
obnie dodatni pod względem bakterii B. pertussis, jednak obecność bakterii
B. bronchiseptica również może prowadzić do dodatniego sygnału sekwencji
IS481. W razie potrzeby należy przeprowadzić dodatkowe testy w celu
rozróżnienia między bakterią B. bronchiseptica a B. pertussis.
Ocena wydajności analitycznej
Czułość analityczna (granica wykrywalności)
Granicę wykrywalności (LoD) testu Vivalytic Bordetella określono jako naj-
niższe stężenie analitu, które może być wykrywane w spójny sposób (≥ 95%
próbek badanych w standardowych warunkach laboratoryjnych w przypadku
stosowania zdefiniowanego typu próbki, tabela 1).
Inkluzywność
Aby ocenić inkluzywność, przeprowadzono analizę in silico (zgodność w narzę-
dziu BLAST) sekwencji genomowej różnych stosownych szczepów Bordetella
pertussis, Bordetella parapertussis i Bordetella holmesii w odniesieniu do
sekwencji starterów PCR i sondy hydrolitycznej, które są używane w teście
Vivalytic Bordetella do amplifikacji i wykrywania odpowiednich patogenów.
Inkluzywność można wykazać dla drobnoustrojów, które przedstawia tabela 2.
Ekskluzywność / swoistość analityczna
Aby wykluczyć reaktywność krzyżową (ekskluzywność), przeprowadzono
analizę in silico (zgodność w narzędziu BLAST) regionu docelowego bakterii
Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis i Bordetella holmesii w od-
niesieniu do sekwencji genomowej różnych innych patogenów reprezentu-
jących powszechnie występujące patogeny dróg oddechowych lub blisko
spokrewnione gatunki. W przypadku systemu wykrywania bakterii Bordetella
pertussis można było wykryć zgodności sekwencji w obszarze sondy i starte-
ra dla szczepów bakterii Bordetella bronchispetica NCTC10543, MBORD731,
NCTC8344, E001, MBORD595, co wskazuje na możliwą amplifikację.
W przypadku systemu wykrywania bakterii Bordetella parapertussis można
było wykryć zgodności sekwencji w obszarze sondy i startera dla szczepów
bakterii Bordetella bronchispetica KM22, BB5, FR3523, FR2017, FR3823, co
wskazuje na możliwą amplifikację. Nie potwierdzono obecności interferencji
dla systemu wykrywania bakterii Bordetella holmesii (tabela 3).
Odtwarzalność
Odtwarzalność testu Vivalytic Bordetella określono przy użyciu panelu
z 3 różnymi stężeniami bakterii Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis
i Bordetella holmesii. W trzech ośrodkach badawczych każda mieszanina
została przetestowana na tym samym zestawie aparatów Vivalytic przez tego
samego operatora przy użyciu odpowiednio 3 serii, w 4 powtórzeniach, w
ciągu 3 dni. Odsetek uzyskanych wyników dodatnich w zakresie różnych
kombinacji skorelowano z odsetkiem oczekiwanych wyników dodatnich
(tabela 4a).
Powtarzalność
Powtarzalność testu Vivalytic Bordetella określono przy użyciu panelu
z 1 stężeniem (3 × c95) bakterii Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis
i Bordetella holmesii. W 1 ośrodku badawczym każda mieszanina została
— instrukcja użytkowania
91
).
q
Publicité
