Publicité
Vivalytic Bordetella
Evaluatie van de analytische prestaties
Analytische gevoeligheid (detectielimiet)
De detectielimiet (LoD) van de Vivalytic Bordetella-test werd bepaald als de
laagste concentratie van de analyt die consistent gedetecteerd kan worden
(≥ 95 % van de monsters getest onder routinematige laboratoriumomstandig-
heden met een gedefinieerd type monster, tabel 1).
Inclusiviteit
Om de inclusiviteit te evalueren, werd een in silico-analyse (BLAST-uitlijning)
uitgevoerd van de genoomsequentie van verschillende relevante Bordetella
pertussis-, Bordetella parapertussis- en Bordetella holmesii-stammen tegen de
sequentie van de PCR-primers en hydrolyseprobe die gebruikt worden in de
Vivalytic Bordetella-test voor amplificatie en detectie van de respectievelijke
ziekteverwekkers. Inclusiviteit kon worden aangetoond voor organismen in
tabel 2.
Exclusiviteit/analytische specificiteit
Om kruisreactiviteit (exclusiviteit) uit te sluiten, werd er een in silico-analy-
se (BLAST-uitlijning) uitgevoerd van de doelregio van Bordetella pertussis,
Bordetella parapertussis en Bordetella holmesii tegen de genoomsequentie
van verschillende andere pathogenen die veel voorkomende respiratoire
ziekteverwekkers of nauw verwante soorten vertegenwoordigen. Voor het
detectiesysteem van Bordetella pertussis konden sequentie-overeenkom-
sten in het probe- en primergebied worden gedetecteerd voor de Bordetella
bronchispetica-stammen NCTC10543, MBORD731, NCTC8344, E001,
MBORD595, wat een mogelijke amplificatie tot gevolg had. Voor het detec-
tiesysteem van Bordetella parapertussis konden sequentie-overeenkomsten
in het probe- en primergebied worden gedetecteerd voor de Bordetella
bronchispetica-stammen KM22, BB5, FR3523, FR2017, FR3823, waaruit een
mogelijke amplificatie geconcludeerd kan worden. Er was geen bewijs van
interferentie voor het detectiesysteem van Bordetella holmesii (tabel 3).
Reproduceerbaarheid
De reproduceerbaarheid van de Vivalytic Bordetella-test werd vastgesteld
met behulp van een panel met 3 verschillende concentraties Bordetella
pertussis, Bordetella parapertussis en Bordetella holmesii. Elk mengsel werd
respectievelijk 4 keer op 3 verschillende dagen op 3 testlocaties getest op
dezelfde Vivalytic-instrumenten door dezelfde operator met 3 LOT's. De
verkregen percentages positieven voor de verschillende combinaties werden
gecorreleerd met de verwachte percentages (tabel 4a).
Herhaalbaarheid
De herhaalbaarheid van de Vivalytic Bordetella-test werd vastgesteld met
behulp van een panel met 1 concentratie (3x c95) van Bordetella pertussis,
Bordetella parapertussis en Bordetella holmesii. Op 1 testlocatie werd de mix
getest op dezelfde set Vivalytic-instrumenten door dezelfde operator met
3 LOT's in 20 herhalingen, wat in totaal 60 waarnemingen per doelpathogeen
opleverde. De verkregen percentages positieven voor de verschillende com-
binaties werden gecorreleerd met de verwachte percentages (tabel 4b).
Interferenties
Interferenties zijn geëvalueerd voor endogene en exogene stoffen, die moge-
lijk aanwezig zijn in het patiëntmonster. Raadpleeg tabel 5 voor stoffen die
de test kunnen verstoren. Er werden geen interferenties gedetecteerd.
– Gebruiksaanwijzing
21
Publicité
