Vivalytic Bordetella
– Használati útmutató
Reagensek
A patron a mintafeldolgozáshoz szükséges minden reagenst tartalmaz. A
feldolgozás során sejtlízis, nukleinsav-extrahálás, valamint DNS-amplifikálás
és kimutatás történik.
A reagensek a PCR-gyöngy, a kötőpuffer, a mosópuffer és az eluálópuffer.
A PCR-gyöngy tartalmazza a DNS-polimerázt, a primereket és próbákat.
A kötőpuffer segíti elő a nukleinsavak kötését a tisztítási folyamat során. A
mosópuffer különböző sókból és oldószerekből álló anyag, amelynek célja
a szennyeződések, pl. fehérjék eltávolítása az extrahálási folyamat során. Az
eluálópuffer alacsony sótartalmú puffer, amely az extrahálási folyamat végén
a tisztított nukleinsavakat tartalmazza.
Mintatípusok/közeg
A teszt a B. pertussis (IS481 célszekvencia), a B. parapertussis (pIS1001
célszekvencia) és a B. holmesii (IS481, hIS1001 célszekvenciák)
nukleinsavainak kimutatására szolgál orrgarat-tamponmintákból
(FLOQSwabs® 553C rugalmas pelyhesített tampon) eNAT® szállítóközegben
(eNAT® szállítóközeg Ref. 608C, COPAN Italia s.p.a.).
A mintákat a gyártói utasításokban megjelöltek szerint vegye le és tárolja [3].
Amennyiben a mintát nem dolgozzák fel azonnal a mintavételt követően, a
nukleinsavak az eNAT® szállítóközegben szobahőmérsékleten és 4 °C-on
4 hétig, –20 °C és –80 °C között tárolva 6 hónapig megőrződnek (lásd az
eNAT® szállítóközeg használati útmutatóját [3]).
Minta-előkészítés
Használjon COPAN FLOQSwabs® rugalmas vattapálcát az orrgaratból
történő mintavételre. A keneteket helyezze 1 ml eNAT® szállítóközegbe. Törje
le a vattapálca szárát, és zárja le a csövet. Rázással homogenizálja az eNAT®
közegben lévő kenetmintát tartalmazó mintacsövet (de ne képződjön hab).
Töltsön 300 μl homogenizált mintát a patron mintabemenetébe, és zárja le
a patron fedelét. Helyezze a patront a Vivalytic one analizátorba.
Ne használjon viszkózus, nehezen pipettázható mintákat.
Teszteredmény
A minta Vivalytic one analizátorral történő automatikus feldolgozását köve-
tően a teszteredmény megjelenik a Vivalytic one analizátor képernyőjén. Az
eredmény eléréséhez szükséges idő körülbelül 50 perc. Magas titerű minták
esetében az eredmény már kevesebb mint 33 perc alatt megjelenik, és a tesz-
tfuttatás korábban is befejezhető (lásd a Teszt befejezése című fejezetet).
A minta besorolása lehet B. pertussis kórokozóra pozitív, B. parapertussis
kórokozóra pozitív, B. holmesii kórokozóra pozitív, negatív vagy érvénytelen,
vagy ezek kombinációja. Ha a teszt kimutatott egy vagy több célszekvenciát,
az eredmény akkor is érvényesnek minősül, ha a Human Control negatív.
A humánsejt-alapú teljes folyamatkontroll (Human Control) kimutatása
negatív mintákban sikeres DNS-tisztítási és amplifikálási folyamatot jelez,
és kizárja a PCR-reakció gátlását. Az eredmények értelmezését az alábbi
táblázat tartalmazza.
109