Publicité
Vivalytic Bordetella
– brugsanvisning
Evaluering af analytisk funktion
Analytisk følsomhed (detektionsgrænse)
Detektionsgrænsen (LoD) for Vivalytic Bordetella-testen blev bestemt som
den laveste analytkoncentration, der kan detekteres konsekvent (≥ 95 % af
de prøver, der blev testet under gældende laboratoriebetingelser ved brug af
en defineret prøvetype, tabel 1).
Inklusivitet
For at evaluere inklusiviteten blev der udført en in silico-analyse (BLAST-sam-
menligning) af den genomiske sekvens af forskellige relevante Bordetella
pertussis-, Bordetella parapertussis- og Bordetella holmesii-stammer mod se-
kvensen af de PCR-primere og den hydrolyseprobe, der blev brugt i Vivalytic
Bordetella-testen til forstærkning og detektion af de pågældende patogener.
Inklusiviteten kunne vises for de organismer, der er angivet i tabel 2.
Eksklusivitet/analytisk specificitet
For at udelukke krydsreaktivitet (eksklusivitet) blev der udført en in
silico-analyse (BLAST-sammenligning) af target-regionen for Bordetella
pertussis, Bordetella parapertussis og Bordetella holmesii mod den genomiske
sekvens af forskellige andre patogener, der repræsenterer almindelige
luftvejspatogener eller nært beslægtede arter. For detektionssystemet for
Bordetella pertussis kunne der detekteres sekvensoverensstemmelser i pro-
be- og primerområdet for Bordetella bronchispetica-stammerne NCTC10543,
MBORD731, NCTC8344, E001 og MBORD595 efter en mulig forstærkning.
For detektionssystemet for Bordetella parapertussis kunne der detekte-
res sekvensoverensstemmelser i probe- og primerområdet for Bordetella
bronchispetica-stammerne KM22, BB5, FR3523, FR2017 og FR3823 efter en
mulig forstærkning. Der blev ikke konstateret interferens for detektionssyste-
met for Bordetella holmesii (tabel 3).
Reproducerbarhed
Reproducerbarheden af Vivalytic Bordetella-testen blev fastlagt ved brug af
et panel med 3 forskellige koncentrationer af Bordetella pertussis, Bordetella
parapertussis og Bordetella holmesii. På 3 teststeder blev hver blanding testet
på det samme sæt Vivalytic-instrumenter af den samme bruger med 3 lot i
henholdsvis 4 bestemmelser over 3 dage. De indhentede positivitetsrater for
de forskellige kombinationer blev korreleret med den forventede positivitets-
rate (tabel 4a).
Repeterbarhed
Repeterbarheden af Vivalytic Bordetella-testen blev fastlagt ved brug af et
panel med 1 koncentration (3 × c95) af Bordetella pertussis, Bordetella para-
pertussis og Bordetella holmesii. På 1 teststed blev blandingen testet på det
samme sæt Vivalytic-instrumenter af den samme bruger i henholdsvis 3 lot
i 20 bestemmelser, hvilket gav i alt 60 observationer pr. target-patogen. De
indhentede positivitetsrater for de forskellige kombinationer blev korreleret
med den forventede positivitetsrate (tabel 4b).
Interferenser
Interferenser blev evalueret for endogene og eksogene stoffer, som eventuelt
findes i patientprøven. Se tabel 5 vedrørende stoffer, der kan forstyrre
testen. Der blev ikke detekteret nogen interferens.
Evaluering af klinisk funktion
Resultater af følsomhed og specificitet udledt af oprindelige nasofaryngeale
podeprøver. Prøverne blev udtaget i kliniske omgivelser og sammenlignet
med resultater af referencemetoder.
561 nasofaryngeale podeprøver i eNAT blev testet på ét undersøgelsessted
med brug af en screeningstilgang med potentielle kliniske positive prøver. 8
kliniske prøver blev fundet positive for et ud af tre patogener (alle Borde-
tella parapertussis) med en positivitetsrate inden for prøvesættet på 1,9 %
(8/411) til følge. Derudover fik 150 negativt forkarakteriserede prøver tilsat
det respektive referencemateriale (50 prøver pr. patogen).
I alt 495 resultater blev inkluderet i datasættet opnået med testning med en
referencetest (Bordetella Speciation Plus Toxin – OSR for BD MAX™) og Viva-
lytic Bordetella, hvilket gav de performanceresultater, der er vist i tabel 6.
63
Publicité
