Publicité
Vivalytic Bordetella
– Käyttöopas
Reagenssit
Kaikki näytteen käsittelyyn tarvittavat reagenssit on integroitu kasettiin.
Käsittely sisältää solulyysin, nukleiinihapon uuttamisen, DNA-monistuksen
ja tunnistamisen.
Reagensseja ovat PCR-helmi, sidospuskuri, pesupuskuri ja eluutiopuskuri.
PCR-helmi sisältää DNA-polymeraasin, primeerit ja koettimet. Sidospus-
kuri helpottaa nukleiinihappojen sitomista puhdistusprosessin aikana.
Pesupuskuri koostuu erilaisista suoloista ja liuottimista epäpuhtauksien,
kuten proteiinien, poistamiseksi uuttoprosessin aikana. Eluutiopuskuri on
vähäsuolainen puskuri, joka sisältää puhdistettuja nukleiinihappoja uutto-
prosessin lopussa.
Näytetyypit/väliaine
Testi on tarkoitettu osoittamaan patogeenien B. pertussis (geenin
kohdesekvenssi IS481), B. parapertussis (geenin kohdesekvenssi pIS1001)
ja B. holmesii (geenin kohdesekvenssit IS481, hIS1001) nukleiinihapot
nenänielunäytteistä (joustava Flocked Swab FLOQSwabs® 553C) eNAT®-
väliaineessa (eNAT®-väliaine Ref. 608C, COPAN Italia s.p.a.).
Kerää ja säilytä näytteitä valmistajan ohjeissa esitetyllä tavalla [3].
Jos näytettä ei käsitellä välittömästi näytteenoton jälkeen, nukleiinihapot
säilyvät eNAT®-kuljetusväliaineessa enintään 4 viikkoa huoneenlämmössä
ja enintään 6 kuukautta 4 °C:ssa ja -20 °C – -80 °C:ssa (katso eNAT®-
kuljetusväliaineen käyttöohjeet [3]).
Näytteen valmistelu
Käytä joustavaa COPAN FLOQSwabs® -näytetikkua näytteen ottamiseen
potilaan suunielusta ja/tai nenänielusta. Siirrä kukin näytetikku 1 ml:aan
eNAT®-kuljetusväliainetta. Katkaise näytetikku ja sulje putki. Homogenoi
näytetikun ja eNAT®-väliaineen sisältävän näyteputken sisältö ravistamalla
(vältä vaahtoamista). Lisää 300 μl homogenoitua näytettä kasetin näytteen-
syöttöaukkoon ja sulje kasetin kansi. Aseta kasetti Vivalytic one -analysointi-
laitteeseen.
Älä käytä viskoosisia näytteitä, joita on vaikea pipetoida.
Testitulos
Kun näyte on käsitelty automaattisesti Vivalytic one -analysointilaitteella,
testitulos näkyy Vivalytic one -analysointinäytteen näytössä. Testituloksen
valmistumisaika on noin 50 minuuttia. Korkean pitoisuuden näytteiden tu-
lokset ovat käytettävissä alle 33 minuutissa, ja testin suorittaminen voidaan
päättää etuajassa (katso luku Testin päättäminen).
Näyte luokitellaan joko B. pertussis -positiiviseksi, B. parapertussis -positii-
viseksi, B. holmesii -positiiviseksi, negatiiviseksi tai virheelliseksi tai edellä
mainittujen yhdistelmäksi. Jos ainakin yksi kohde tunnistetaan positiiviseksi,
testin katsotaan onnistuneen, vaikka Human Control olisi negatiivinen.
Ihmissoluun perustuvan koko prosessin kontrollin (Human Control) havait-
seminen negatiivisista näytteistä osoittaa onnistuneen DNA-puhdistuksen ja
vahvistuksen ja sulkee pois PCR-reaktion eston. Tulosten tulkinta esitetään
alla olevassa taulukossa.
53
Publicité
