Publicité
Vivalytic Bordetella
Περιορισμοί
Τα αποτελέσματα της εξέτασης Vivalytic Bordetella πρέπει να ερμηνεύονται
μόνο από εκπαιδευμένο επαγγελματία υγείας. Τα αποτελέσματα της εξέτασης
Vivalytic Bordetella δεν πρέπει να χρησιμοποιούνται ως η μοναδική παράμε-
τρος για τη διάγνωση.
• Ένα αρνητικό αποτέλεσμα δεν αποκλείει την ύπαρξη παθογόνων στο δείγμα
σε επίπεδο χαμηλότερο από την ευαισθησία του προσδιορισμού ή την
ύπαρξη άλλων παθογόνων που δεν καλύπτονται από τον συγκεκριμένο
προσδιορισμό.
• Υπάρχει κίνδυνος ψευδώς αρνητικών ή ψευδώς θετικών αποτελεσμάτων που
οφείλονται σε ακατάλληλη συλλογή, μεταφορά ή χειρισμό των δειγμάτων.
• Σε οριακές περιπτώσεις, ενδέχεται να προκύψουν άτυπα χαρακτηριστικά PCR
(π.χ. επίπεδη καμπύλη με χαμηλή ή υψηλή τιμή C
χαρακτηριστικών, τα αποτελέσματα δεν επιτρέπεται να χρησιμοποιηθούν για
διαγνωστική ερμηνεία. Συνιστάται να γίνεται επανεξέταση.
• Ένα θετικό αποτέλεσμα δεν σημαίνει απαραίτητα ότι υπάρχουν βιώσιμα
παθογόνα.
• Το Vivalytic Bordetella είναι μια ποιοτική εξέταση βάσει PCR πραγματικού
χρόνου και δεν παρέχει ποσοτικό αποτέλεσμα.
• Θετικό IS481 και hIS1001 μπορεί να οφείλεται είτε στην παρουσία B. hol-
mesii είτε στην παρουσία B. pertussis και B. holmesii στο δείγμα.
• Θετικό IS481 μπορεί να θεωρηθεί ως πιθανό θετικό για B. pertussis, παρόλο
που η B. bronchiseptica μπορεί επίσης να οδηγήσει σε θετικό σήμα IS481.
Εάν χρειάζεται, θα πρέπει να διενεργηθούν πρόσθετες εξετάσεις για τη
διαφοροποίηση της B. bronchiseptica και της B. pertussis.
Αξιολόγηση της αναλυτικής απόδοσης
Αναλυτική ευαισθησία (Όριο ανίχνευσης)
Ως όριο ανίχνευσης (LoD) της εξέτασης Vivalytic Bordetella προσδιορίστηκε
η χαμηλότερη συγκέντρωση αναλυόμενης ουσίας που μπορεί να ανιχνευτεί
σταθερά (≥95% των δειγμάτων που εξετάστηκαν υπό εργαστηριακές συνθήκες
ρουτίνας με τη χρήση καθορισμένου τύπου δείγματος, Πίνακας 1).
Συμπερίληψη
Για την αξιολόγηση της συμπερίληψης, πραγματοποιήθηκε ανάλυση in silico
(ευθυγράμμιση BLAST) της αλληλουχίας του γονιδιώματος διαφόρων συνα-
φών στελεχών Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis και Bordetella
holmesii έναντι της αλληλουχίας των εκκινητών PCR και του ανιχνευτή υδρόλυ-
σης που χρησιμοποιούνται στην εξέταση Vivalytic Bordetella για την ενίσχυση
και την ανίχνευση των αντίστοιχων παθογόνων. Συμπερίληψη θα μπορούσε να
καταδειχθεί για τους οργανισμούς που παρατίθενται στον Πίνακα 2.
Αποκλεισμός/Αναλυτική ειδικότητα
Προκειμένου να αποκλειστεί η διασταυρούμενη αντιδραστικότητα (απο-
κλεισμός), πραγματοποιήθηκε ανάλυση in silico (ευθυγράμμιση BLAST)
της περιοχής στόχου της Bordetella pertussis, της Bordetella parapertussis
και της Bordetella holmesii έναντι των αλληλουχιών γονιδιώματος διαφόρων
άλλων κοινών παθογόνων του αναπνευστικού ή στενών συγγενικών ειδών. Για
το σύστημα ανίχνευσης της Bordetella pertussis, οι αντιστοιχίες αλληλουχιών
στην περιοχή ανιχνευτή και εκκινητών θα μπορούσαν να ανιχνευθούν για τα
στελέχη της Bordetella bronchiseptica NCTC10543, MBORD731, NCTC8344,
E001, MBORD595, καταλήγοντας σε πιθανή ενίσχυση. Για το σύστημα ανίχνευ-
σης της Bordetella parapertussis, οι αντιστοιχίες αλληλουχιών στην περιοχή
ανιχνευτή και εκκινητών θα μπορούσαν να ανιχνευθούν για τα στελέχη της
Bordetella bronchiseptica KM22, BB5, FR3523, FR2017, FR3823, καταλήγο-
ντας σε πιθανή ενίσχυση. Δεν υπήρξαν στοιχεία παρεμβολής για το σύστημα
ανίχνευσης της Bordetella holmesii (Πίνακας 3).
Αναπαραγωγιμότητα
Η αναπαραγωγιμότητα της εξέτασης Vivalytic Bordetella διαπιστώθηκε με τη
χρήση μιας ομάδας με 3 διαφορετικές συγκεντρώσεις Bordetella pertussis,
Bordetella parapertussis και Bordetella holmesii. Σε 3 περιοχές εξέτασης, κάθε
μίγμα εξετάστηκε με το ίδιο σετ οργάνων Vivalytic από τον ίδιο χειριστή σε
3 παρτίδες σε 4 επαναληπτικά δείγματα σε 3 ημέρες, αντίστοιχα. Τα ποσοστά
θετικότητας που προέκυψαν για τους διαφορετικούς συνδυασμούς συσχετί-
στηκαν με το αναμενόμενο ποσοστό θετικότητας (Πίνακας 4α).
– Οδηγίες χρήσης
147
). Σε περίπτωση άτυπων
q
Publicité
