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• Il existe un risque de résultats faux négatifs ou faux positifs résultant
d'échantillons prélevés, transportés ou manipulés de manière inappro-
priée.
• Dans les cas limites, des caractéristiques de PCR atypiques peuvent
survenir (par ex. courbe plane avec valeur C
caractéristiques atypiques, les résultats ne peuvent pas être utilisés pour
l'interprétation du diagnostic. Il est recommandé de recommencer le test.
• Un résultat positif n'implique pas forcément la présence de pathogènes
viables.
• Vivalytic Bordetella est un test PCR qualitatif en temps réel qui ne fournit
pas de résultats quantitatifs.
• Des cibles IS481 et hIS1001 positives peuvent être provoquées soit par la
présence de B. holmesii ou par la présence de B. pertussis et B. holmesii
dans l'échantillon.
• Une cible IS481 positive peut être considérée comme probablement po-
sitive à B. pertussis, bien que B. bronchiseptica puisse aussi engendrer un
signal positif pour IS481. Selon les besoins, des tests supplémentaires doi-
vent être réalisés afin de différencier entre B. bronchiseptica et B. pertussis.
Évaluation des performances analytiques
Sensibilité analytique (limite de détection)
La limite de détection du test Vivalytic Bordetella a été déterminée comme
étant la concentration la plus faible d'analyte pouvant être régulièrement
détectée (≥ 95 % d'échantillons testés dans des conditions de laboratoire de
routine à l'aide d'un type d'échantillon défini, Tableau 1).
Inclusivité
Pour évaluer l'inclusivité, l'analyse in silico (alignement BLAST) de la sé-
quence génomique de différentes souches pertinentes de Bordetella pertus-
sis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii par rapport à la séquence
des amorces PCR et la sonde d'hydrolyse utilisées dans le test Vivalytic
Bordetella pour l'amplification et la détection des pathogènes correspon-
dants a été réalisée. L'inclusivité peut être démontrée pour les organismes
répertoriés dans le Tableau 2.
Exclusivité / Spécificité analytique
Pour exclure la réactivité croisée (exclusivité), une analyse in silico (aligne-
ment BLAST) de la région cible de Bordetella pertussis, Bordetella paraper-
tussis et Bordetella holmesii par rapport à la séquence génomique de divers
autres pathogènes représentant des pathogènes respiratoires communs
ou des espèces étroitement apparentées a été réalisée. Pour le système de
détection de Bordetella pertussis, des correspondances de séquence dans
la zone de la sonde et de l'amorce ont pu être détectées pour les souches
de Bordetella bronchispetica NCTC10543, MBORD731, NCTC8344, E001,
MBORD595, concluant à une amplification possible. Pour le système de dé-
tection de Bordetella parapertussis, des correspondances de séquence dans
la zone de la sonde et de l'amorce ont pu être détectées pour les souches de
Bordetella bronchispetica KM22, BB5, FR3523, FR2017, FR3823, concluant
à une amplification possible. Aucune interférence n'a été constatée pour le
système de détection de Bordetella holmesii (Tableau 3).
Reproductibilité
La reproductibilité du test Vivalytic Bordetella a été établie à l'aide d'un
panel présentant 3 différentes concentrations de Bordetella pertussis,
Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii. Sur trois sites d'essai, chaque
mélange a été testé sur le même ensemble d'instruments Vivalytic par le
même opérateur avec 3 LOTS, en 4 réplicats sur 3 jours, respectivement. Les
taux de positivité obtenus pour les différentes combinaisons ont été corrélés
au taux de positivité attendus (Tableau 4a).
Répétabilité
La répétabilité du test Vivalytic Bordetella a été établie à l'aide d'un panel pré-
sentant 1 concentration (3 × c95) de Bordetella pertussis, Bordetella paraper-
tussis et Bordetella holmesii. Sur 1 site d'essai, le mélange a été testé sur le
même ensemble d'instruments Vivalytic par le même opérateur avec 3 LOTS
en 20 réplicats, respectivement, ce qui a donné un total de 60 observations
par agent pathogène cible. Les taux de positivité obtenus pour les différentes
combinaisons ont été corrélés au taux de positivité attendus (Tableau 4b).
Vivalytic Bordetella
28
– Manuel de l'utilisateur
faible ou élevée). En cas de
q
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