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Onglet Liste pour l'expression génique
L'onglet Liste contient un tableau avec un aperçu des puits analysés. Les colonnes suivantes sont disponibles dans le tableau :
Puits – Cette colonne représente la position du puits dans la disposition des plaques.
•
Nom/ID – Cette colonne affiche le nom de l'échantillon, du NTC ou du contrôle avec son icône correspondante qui
•
identifie l'échantillon ou indique si l'entrée est un NTC ou un contrôle. Les échantillons de référence sont marqués du
mot Ref.
Mélange réactionnel – Cette colonne contient l'icône et le nom du mélange réactionnel.
•
Cible – Cette colonne affiche tous les noms de cibles avec leur type de cible correspondant. Les cibles sélectionnées
•
comme cibles d'intérêt (TOI) ou cibles de référence (Ref) sont marquées en conséquence.
Concentration (copies/μl) – Cette colonne indique la concentration attribuée à chaque cible.
•
IC (95%) – Cette colonne présente la valeur de l'intervalle de confiance à un niveau de confiance de 95 %.
•
Fold change – Cette colonne présente l'évolution du niveau d'expression génétique dans l'échantillon.
•
IC (95%) – Cette colonne présente la valeur de l'intervalle de confiance pour le changement du repliement à un niveau
•
de confiance de 95 %.
Régulation du fold – Cette colonne présente l'évolution du niveau d'expression génétique par rapport à l'échantillon
•
de référence.
Les répliques sont traitées différemment pour la configuration de test multiplex et simplex :
Test multiplex (la cible d'intérêt configurée et les cibles de référence font partie du même mélange réactionnel) :
•
Sur le côté droit au-dessus du tableau, un commutateur permet à l'utilisateur d'afficher les valeurs moyennes des
o
répliques. Par défaut, le bouton n'est pas coché et les résultats sont affichés sans valeurs moyennes. Lorsque le
bouton est coché, la vue de liste affiche toujours des lignes indépendantes pour chaque puits sélectionné, mais les
répliques sont regroupées. Les répliques du même groupe sont regroupées dans la vue de liste. La vue liste est
prolongée par 5 colonnes indiquant les valeurs moyennes suivantes :
Valeur de concentration moyenne
■
IC (95 %) — IC de la concentration moyenne en pourcentage
■
Fold-change moyen
■
IC (95 %) — IC du fold change moyen en pourcentage
■
Régulation moyenne du fold
■
Test simplex (la cible d'intérêt configurée et les cibles de référence font partie de mélanges réactionnels différents) :
•
Pour les tests ayant des cibles configurées dans différents puits/mélanges de réaction, le résultat moyen est calculé
o
et affiché pour les répliques dans la sélection. La vue liste est prolongée par 5 colonnes indiquant les valeurs
moyennes suivantes :
Valeur de concentration moyenne
■
IC (95 %) — IC de la concentration moyenne en pourcentage
■
Fold-change moyen
■
IC (95 %) — IC du fold change moyen en pourcentage
■
Régulation moyenne du fold
■
Manuel d'utilisation du système QIAcuityDx | 07/2024
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