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Notice relative à l'instrument NovaSeq 6000Dx
Tableau 30
Estimations des composants de variance de précision intra-laboratoire pour les fréquences
de variants des échantillons somatiques
Composant
Jour
Instrument
Lot de consommables
Réplicat de librairie
Total
Comparaison des méthodes
Une étude a été réalisée pour comparer les performances entre les instruments NovaSeq 6000Dx et NextSeq
550Dx. L'accord de fréquence des variants pour les échantillons de sang a été évalué à l'aide d'un test
représentatif conçu pour étudier une variété de gènes couvrant 1 970 505 bases sur les 23 chromosomes
humains. Huit échantillons d'ADN de Platinium Genome ont été testés, sept en six réplicats et un (NA12881) en
cinq réplicats. Les librairies ont été séquencées sur le Instrument NovaSeq 6000Dx à l'aide du flux de travail de
génération d'analyse FASTQ et VCF pour le variant germinal de l'application DRAGEN for Illumina DNA Prep with
Enrichment Dx, et sur l'instrument NextSeq 550Dx à l'aide du module DNA Generate FASTQ Dx Local Run
Manager.
Tracés de corrélation de fréquence de variant (les points sont colorés par variant unique. Les variants
peuvent être colorés différemment dans chaque tracé individuel) à la page 71
deux instruments pour chaque échantillon. Sur la base de la forte corrélation entre Instrument NovaSeq 6000Dx
et l'instrument NextSeq 550Dx, les caractéristiques de performance liées aux facteurs pré-analytiques (par
exemple, les méthodes d'extraction ou les substances interférentes) sont déterminées comme étant
applicables aux deux instruments. Consultez la notice du Illumina DNA Prep with Enrichment Dx pour obtenir
davantage de détails.
Document n°200025276 v01
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
POUR EXPORTATION UNIQUEMENT
ET moyen
% moyen de l'ET total
0,0002
0,41
0,0002
0,40
0,0002
0,35
0,0044
50,7
0,0062
100
trace la corrélation FAV entre les
70 sur 74
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