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Notice relative à l'instrument NovaSeq 6000Dx
Flux de travail de Real-Time Analysis
Enregistrement
Extraction des
intensités
Correction de la mise
en phase
Définition des bases
Notation de la qualité
Enregistrement
La fonction d'enregistrement aligne une image au réseau de forme losange de nanopuits sur la Flow Cell
structurée. En raison de l'arrangement ordonné des nanopuits, les coordonnées X et Y sont prédéterminées
pour chaque amplifiat dans une plaque. Les positions des amplifiats de chaque analyse s'inscrivent dans un
même fichier d'emplacement des amplifiats (s.locs).
S'il y a échec d'enregistrement d'une image d'un cycle, aucune définition des bases ne sera générée pour cette
plaque dans ce cycle.
Extraction des intensités
Après l'enregistrement, la fonction d'extraction des intensités calcule une valeur d'intensité pour chaque
nanopuits dans une image donnée. Si l'enregistrement échoue, l'intensité de la plaque ne peut pas être extraite.
Correction de la mise en phase
Lors de la réaction de séquençage, chaque brin d'ADN dans un amplifiat s'étend d'une base par cycle. La mise
en phase et la mise en préphase ont lieu lorsqu'un brin est déphasé par rapport au cycle d'incorporation en
cours.
La mise en phase se produit lorsqu'un brin a un retard d'une base.
La mise en préphase se produit lorsqu'un brin a une avance d'une base.
Document n°200025276 v01
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
POUR EXPORTATION UNIQUEMENT
Enregistre l'emplacement de chaque amplifiat sur la Flow Cell structurée.
Détermine une valeur d'intensité pour chaque amplifiat.
Corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase.
Détermine une définition des bases pour chaque amplifiat.
Attribue un score de qualité à chaque définition des bases.
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