Manuels Connexes pour illumina iSeq 100
Sommaire des Matières pour illumina iSeq 100
- Page 1 Guide du système de séquençage Document nº 1000000036024 v05 FRA EXCLUSIF À ILLUMINA Mars 2019 Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
- Page 2 écrit préalable d’Illumina. Illumina ne cède aucune licence en vertu de son brevet, de sa marque de commerce, de ses droits d’auteur ou de ses droits traditionnels ni des droits similaires d’un tiers quelconque par ce document.
- Page 3 -25 °C et -15 °C pour au moins une journée avant de la décongeler dans un bain d’eau. Correction apportée au nom de la librairie AmpliSeq PLUS pour Illumina. Document nº 1000000036024 v05 FRA Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
- Page 4 • Mise hors tension et redémarrage de l’instrument lors de la restauration des paramètres initiaux. Ajout de la référence au document sur les séquences d’adaptateurs Illumina (document nº 1000000002694) pour voir l’orientation de l’index 2 (i5) pour une feuille d’échantillons. Clarification des éléments suivants : •...
- Page 5 • Ajout de renseignements sur l’indicateur du taux d’occupation. • Augmentation à 50 µl du volume de contrôle PhiX 1 nM lors de l’ajout d’une substance de contrôle. Mise à jour des numéros de référence d’Illumina pour les composants suivants : • Tampon de rechange pour plateau d’égouttage iSeq 100, nº 20023927.
- Page 6 Guide du système de séquençage iSeq 100 Document Date Description des modifications Document Ajout des diverses directives suivantes : • Exécution d’analyses de validation. nº 1000000036024 v01 2018 • Création d’une feuille d’échantillons lors du séquençage en mode manuel. • Réduction de la fenêtre du logiciel de commande pour accéder aux autres applications.
-
Page 7: Table Des Matières
Table des matières Chapitre 1 Vue d’ensemble Introduction Ressources supplémentaires Composants de l’instrument Réactif i1 iSeq 100 Chapitre 2 Pour commencer Configuration initiale Réduire la fenêtre du logiciel de commande Paramètres de l’analyse Personnalisation de l’instrument Configuration du réseau Consommables et équipement fournis par l’utilisateur Chapitre 3 Séquençage Introduction Décongeler la cartouche ensachée... - Page 8 Guide du système de séquençage iSeq 100 Recevoir un système de remplacement Préparer le système d’origine pour le retour Retourner le système d’origine Index Assistance technique Document nº 1000000036024 v05 FRA viii Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
-
Page 9: Chapitre 1 Vue D'ensemble
Le système de séquençage iSeq 100 d’Illumina présente une approche ciblée pour le séquençage nouvelle génération (SNG). Ce système axé sur les applications offre la technologie de séquençage d’Illumina dans un instrument de bureau économique. Fonctionnalités Accessibilité et fiabilité : le système iSeq 100 est compact, et facile à installer et à utiliser. Les composants fluidiques et d’imagerie sont intégrés à... -
Page 10: Ressources Supplémentaires
Ressources supplémentaires pages d’assistance du système de séquençage iSeq 100 sur le site Web d’Illumina comprennent des ressources additionnelles concernant le système. Ces ressources comprennent des logiciels, des documents de formation, les produits compatibles et les documents ci-dessous. Consultez régulièrement les pages d’assistance pour voir la plus récente version de ces documents. -
Page 11: Composants De L'instrument
Guide du système de séquençage iSeq 100 Composants de l’instrument Le système de séquençage iSeq 100 comporte un bouton de mise en marche, un écran, une barre d’état, un compartiment destiné aux consommables et un plateau d’égouttage. Figure 2 Composants externes du système A Bouton de mise en marche : ce composant contrôle l’alimentation de l’instrument et indique si le système est en marche (le voyant est allumé), à... - Page 12 Guide du système de séquençage iSeq 100 Figure 3 Composants du panneau arrière A Port Ethernet : connexion facultative du câble Ethernet. B Deux ports USB : connexions des composants auxiliaires. C Interrupteur : mise en marche ou arrêt de l’instrument. D Entrée pour l’alimentation CA : connexion du cordon d’alimentation. Compartiment des consommables Le compartiment des consommables contient la cartouche pour l’analyse de séquençage.
- Page 13 Guide du système de séquençage iSeq 100 Cartouche et Flow Cell d’essai réutilisables L’instrument est livré avec la Flow Cell d’essai iSeq 100 et la cartouche d’essai iSeq 100 réutilisables qui servent aux vérifications du système. Conservez-les dans leur emballage d’origine, à température ambiante. Réutilisez-les jusqu’à...
- Page 14 Manager et le logiciel de commande peuvent nécessiter des entrées de l’utilisateur. Information sur le système Le menu du logiciel de commande comporte une section About (À propos) où se trouvent les coordonnées d’Illumina ainsi que l’information suivante sur le système : le numéro de série; le nom de l’ordinateur et l’adresse IP;...
-
Page 15: Réactif I1 Iseq 100
Guide du système de séquençage iSeq 100 Les processus qui ne s’appliquent pas ne s’affichent pas à l’écran. Par exemple, si une analyse n’est pas connectée à BaseSpace Sequence Hub, l’écran Process Management (Gestion du processus) n’affiche pas l’état de BaseSpace pour cette analyse. Pour résoudre les problèmes relatifs à... - Page 16 Guide du système de séquençage iSeq 100 Rangez les cartouches en les positionnant de façon à ce que les étiquettes de l’emballage soient face vers le haut. Rangez les cartouches pendant au moins une journée avant de les décongeler dans un bain d’eau. Tableau 1 Composants de la trousse Consommable Quantité...
- Page 17 Guide du système de séquençage iSeq 100 Cartouche La cartouche i1 iSeq 100 est préremplie de réactifs de génération d’amplifiats, de réactifs de séquençage, de réactifs pour bases appariées et de réactifs d’indexage. Un réservoir scellé par un opercule d’aluminium est réservé aux librairies, et une fente située à l’avant est réservée à la Flow Cell. La lumière de l’illuminateur atteint la Flow Cell par une fenêtre d’accès dans le haut de la cartouche.
- Page 18 Description Date de péremption du consommable. Pour de meilleurs résultats, utilisez le consommable avant cette date. Fabricant de l’instrument (Illumina). Date de fabrication du consommable. Le consommable est destiné à la recherche uniquement. Numéro de référence du consommable pour son identification*.
- Page 19 Guide du système de séquençage iSeq 100 Symbole Description Températures de stockage en degrés Celsius. Entreposez le consommable en respectant la plage de températures indiquée. * Le symbole REF identifie le composant, alors que le LOT identifie le lot d’origine du composant. Document nº 1000000036024 v05 FRA Destiné...
-
Page 20: Chapitre 2 Pour Commencer
Chapitre 2 Pour commencer Configuration initiale Réduire la fenêtre du logiciel de commande Paramètres de l’analyse Personnalisation de l’instrument Configuration du réseau Consommables et équipement fournis par l’utilisateur Configuration initiale À la première mise en marche du système, le logiciel de commande est lancé et affiche une série d’écrans pour vous guider tout au long de votre première configuration. -
Page 21: Réduire La Fenêtre Du Logiciel De Commande
InterOp, les fichiers journaux, les données sur la performance de l’instrument et les données de l’analyse à BaseSpace Sequence Hub : Assistance Illumina Proactive : cette fonction facilite le dépannage et détecte les pannes potentielles, ce qui permet une maintenance proactive et l’optimisation du temps d’utilisation de l’instrument. Lorsqu’il est activé, le service d’assistance Illumina Proactive envoie les données sur la performance de... - Page 22 Le service envoie les données sur la performance de l’instrument, comme la température et la durée de l’analyse, à Illumina. Ces données facilitent le dépannage par Illumina et lui permettent de détecter les pannes potentielles. Les données de l’analyse ne sont pas envoyées. Pour obtenir plus de renseignements, consultez la note technique d’Illumina Proactive (document n° 1000000052503).
- Page 23 Si vous avez un abonnement Entreprise, saisissez le nom du domaine (URL) utilisé pour l’ouverture de session propre à BaseSpace Sequence Hub dans le champ Enter Private Domain (Saisir le domaine privé). Par exemple : https://votrelabo.basespace.illumina.com. Sélectionnez Next (Suivant). Choisissez si vous voulez intégrer le logiciel de commande à Local Run Manager : Pour créer des analyses de séquençage et analyser les données dans Local Run Manager,...
-
Page 24: Personnalisation De L'instrument
SampleSheet.csv. Téléchargez le modèle de feuille d’échantillons à partir des pages d’assistance du système de séquençage iSeq 100 : iSeq 100 System Sample Sheet Template for Manual Mode (modèle de feuille d’échantillons destiné au mode manuel). -
Page 25: Configuration Du Réseau
Guide du système de séquençage iSeq 100 Enregistrer les miniatures Dans le menu du logiciel de commande, sélectionnez System Settings (Paramètres du système). Sélectionnez l’onglet Customization (Personnalisation). Choisissez si vous voulez enregistrer les images miniatures : Pour enregistrer toutes les miniatures, cochez la case Save all thumbnail images (Enregistrer toutes les miniatures). - Page 26 Guide du système de séquençage iSeq 100 Un fichier de sortie est requis, à moins que le système ne soit configuré pour l’analyse, le partage et le stockage des données, ainsi que la surveillance d’analyse, dans BaseSpace Sequence Hub. Si l’emplacement du dossier de sortie n’est pas précisé, Universal Copy Service copie les fichiers sur D:\SequencingRuns.
-
Page 27: Consommables Et Équipement Fournis Par L'utilisateur
Dilution et chargement des librairies. Pointes de pipette, 100 µl Fournisseur de laboratoire général Dilution et chargement des librairies. Tampon de resuspension Illumina, fourni avec les trousses de Dilution des librairies selon la préparation de librairies concentration de chargement. [Facultatif] Tris-HCl 10 mM, pH 8,5 Fournisseur de laboratoire général... - Page 28 Gants jetables sans talc Fournisseur de laboratoire général Usage général. Tampon de rechange pour plateau Illumina, nº de référence 20023927 Recouvrement du plateau d’égouttage d’égouttage i1 iSeq 100¹ pour absorber les fuites de liquide. Filtre à air de rechange i1 iSeq 100¹...
-
Page 29: Chapitre 3 Séquençage
ADN Nano TruSeq ADN sans PCR TruSeq Pour les autres types de librairies, Illumina recommande une concentration de chargement de 50 pM. Optimisez cette concentration au fil des analyses afin de déterminer une concentration de chargement produisant constamment des données conformes aux spécifications. -
Page 30: Décongeler La Cartouche Ensachée
Guide du système de séquençage iSeq 100 Nombre de cycles recommandé L’exécution d’un minimum de 26 cycles et d’un maximum de 151 cycles par lecture contribue à assurer la qualité des données. Le nombre exact de cycles dépend de votre expérience. Le nombre minimum et maximum de cycles comprend un cycle supplémentaire. Ajoutez toujours un cycle à la longueur de lecture désirée afin de corriger les effets de la mise en phase et de la mise en préphase. -
Page 31: Préparer La Flow Cell Et Les Librairies
PhiX. Les librairies sont automatiquement dénaturées sur l’instrument. Les directives de dilution suivantes s’appliquent aux librairies Illumina prises en charge comportant de l’ADN double brin. Vous devez toujours effectuer une analyse de contrôle de qualité, optimiser la concentration de chargement de votre librairie et utiliser une méthode de normalisation qui génère des librairies d’ADN double... - Page 32 Ce tableau fournit des exemples de concentrations de chargement. Le système iSeq 100 est compatible avec toutes les trousses de préparation de librairies d’Illumina, sauf la trousse SureCell WTA 3′ , mais la concentration optimale de chargement peut varier.
-
Page 33: Charger Les Consommables Dans La Cartouche
Guide du système de séquençage iSeq 100 Ajouter un contrôle PhiX (facultatif) Le contrôle PhiX est une petite librairie Illumina prête à utiliser comportant une représentation équilibrée des nucléotides. L’ajout d’une substance de contrôle PhiX à 2 % à la librairie permet d’obtenir des indicateurs supplémentaires. - Page 34 Guide du système de séquençage iSeq 100 Charger la librairie Utilisez une pointe de pipette neuve pour percer l’opercule du réservoir de la librairie et le pousser jusqu’aux rebords pour agrandir le trou. Jetez la pointe de pipette pour éviter la contamination. Ajoutez 20 µl de librairie diluée au fond du réservoir.
-
Page 35: Configurer Une Analyse De Séquençage (Local Run Manager)
Guide du système de séquençage iSeq 100 A Chargement de la Flow Cell B Flow Cell chargée Mettez au rebut l’emballage de la façon suivante. Sortez l’étui de protection de l’emballage en aluminium. b Retirez l’absorbeur d’humidité de l’étui de protection. Mettez au recyclage l’étui de protection et jetez l’emballage en aluminium et l’absorbeur d’humidité. Procédez en fonction de l’intégration ou non du système à... - Page 36 Pour déconnecter l’analyse en cours de BaseSpace Sequence Hub, sélectionnez Skip BaseSpace Sequence Hub Sign In (Sauter l’ouverture de session de BaseSpace Sequence Hub). Les données de performance de l’instrument sont tout de même envoyées à Illumina. Pour modifier la connectivité pour l’analyse en cours, sélectionnez une option de configuration : Run Monitoring Only (Surveillance de l’analyse seulement) : envoyer seulement les fichiers InterOp à...
- Page 37 Guide du système de séquençage iSeq 100 Sélectionner une analyse Si l’écran Log In (Connexion) de Local Run Manager s’affiche, entrez votre nom d’utilisateur et votre mot de passe, puis sélectionnez Log In (Connexion). L’écran s’affiche lorsque Local Run Manager est configuré de façon à exiger une ouverture de session. Par défaut, il n’est pas nécessaire d’ouvrir une session.
-
Page 38: Configurer Une Analyse De Séquençage (Mode Manuel)
éliminez-les conformément aux lois et règles régionales, nationales et locales en vigueur. Pour obtenir des renseignements supplémentaires sur l’environnement, la santé et la sécurité, consultez la fiche signalétique sur support.illumina.com/sds.html. Sélectionnez Close Door (Fermer la porte) pour recharger le plateau et retourner à l’écran d’accueil. - Page 39 Pour déconnecter l’analyse en cours de BaseSpace Sequence Hub, sélectionnez Skip BaseSpace Sequence Hub Sign In (Sauter l’ouverture de session de BaseSpace Sequence Hub). Les données de performance de l’instrument sont tout de même envoyées à Illumina. Pour modifier la connectivité pour l’analyse en cours, sélectionnez une option de configuration : Run Monitoring Only (Surveillance de l’analyse seulement) : envoyer seulement les fichiers InterOp à...
- Page 40 Guide du système de séquençage iSeq 100 Run Monitoring and Storage (Surveillance d’analyse et stockage) : envoyer les données de l’analyse à BaseSpace Sequence Hub pour permettre la surveillance et l’analyse à distance (feuille d’échantillons requise). Saisissez vos identifiants BaseSpace Sequence Hub (adresse courriel et mot de passe), puis sélectionnez Sign In (Ouverture de session).
- Page 41 Guide du système de séquençage iSeq 100 Examiner les vérifications avant analyse Les vérifications avant analyse comprennent la vérification de l’instrument et du flux. La vérification du flux perce les opercules de la cartouche et fait passer les réactifs dans la Flow Cell. Les consommables ne peuvent donc plus être réutilisés après le début de la vérification du flux.
- Page 42 éliminez-les conformément aux lois et règles régionales, nationales et locales en vigueur. Pour obtenir des renseignements supplémentaires sur l’environnement, la santé et la sécurité, consultez la fiche signalétique sur support.illumina.com/sds.html. Sélectionnez Close Door (Fermer la porte) pour recharger le plateau et retourner à l’écran d’accueil.
-
Page 43: Chapitre 4 Maintenance
Chapitre 4 Maintenance Libérer de l’espace sur le disque dur Mises à jour logicielles Remplacer le filtre à air Déplacer l’instrument Stratégie de restriction logicielle Libérer de l’espace sur le disque dur Une analyse de séquençage nécessite un espace d’environ 2 Go sur le disque dur. Lorsqu’il reste peu d’espace sur le disque dur, suivez les étapes ci-dessous pour effacer les analyses terminées et libérer de l’espace. - Page 44 Guide du système de séquençage iSeq 100 Mises à jour manuelles : les mises à jour sont téléchargées manuellement sur le Web, enregistrées localement ou sur un dispositif portable, et installées à l’emplacement de l’enregistrement. Cette option ne nécessite pas de connexion Internet. Installer automatiquement une mise à...
-
Page 45: Remplacer Le Filtre À Air
L’instrument est livré avec un filtre à air déjà en place, et un de rechange. Des filtres à air de rechange sont compris avec la garantie; vous pouvez aussi vous en procurer auprès d’Illumina. Six mois après la configuration initiale, et tous les six mois par la suite, le logiciel indique qu’il est temps de remplacer le filtre à... - Page 46 Guide du système de séquençage iSeq 100 Retirez le panneau de l’instrument. Retirez le filtre à air en mousse du centre du panneau et jetez-le. Insérez un nouveau filtre à air dans le panneau en appuyant pour vous assurer qu’il reste en place. Insérez les deux crochets du panneau dans les trous réservés à...
-
Page 47: Déplacer L'instrument
Guide du système de séquençage iSeq 100 Déplacer l’instrument Utilisez les instructions suivantes pour déplacer l’instrument de façon sécuritaire. Assurez-vous que le nouvel emplacement respecte les exigences décrites dans le Guide de préparation du site du système de séquençage iSeq 100 (document nº 1000000035337). Si vous retournez un instrument, passez la présente section et reportez-vous à... -
Page 48: Stratégie De Restriction Logicielle
Guide du système de séquençage iSeq 100 12 Lorsque le bouton de mise en marche clignote, appuyez dessus. Figure 8 Emplacement du bouton de mise en marche 13 Lorsque le système d’exploitation est lancé, connectez-vous à Windows. Le logiciel de commande démarre et initialise le système. L’écran d’accueil apparaît lorsque l’initialisation est terminée. - Page 49 Extensions de fichiers *.png *.tif *.txt *.xml Répertoires %HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\ProgramFilesDir% %HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\SystemRoot% C:\CrashDumps\* C:\Illumina Maintenance Logs\* C:\Illumina Manufacturing Test Results\* C:\Illumina\* C:\Program Files (x86)\Chromium\Application\* C:\Program Files (x86)\Illumina\* C:\Program Files (x86)\Internet Explorer\* C:\Program Files\Illumina\* C:\Program Files\Internet Explorer\* C:\Program Files\Jenoptik\* C:\Program Files\Ophir Optronics\* C:\ProgramData\Illumina\*...
- Page 50 Fermez la boîte de dialogue Local Security Policy (Stratégie de sécurité locale). Rétablissez immédiatement la stratégie de restriction logicielle : Accédez au répertoire C:\Illumina\Security. b Faites un double-clic sur Enable.reg. 10 Si vous avez modifié les règles de la stratégie de restriction logicielle pour la première fois, déconnectez- vous, puis reconnectez-vous pour que les règles soient activées.
-
Page 51: Annexe A Sortie De Séquençage
Annexe A Sortie de séquençage Présentation de Real-Time Analysis Flux de travail de Real-Time Analysis Présentation de Real-Time Analysis Le logiciel Real-Time Analysis s’exécute sur l’ordinateur de commande de l’instrument. Pendant une analyse de séquençage, il extrait les intensités des images pour effectuer la définition des bases et associer un score de qualité... - Page 52 FASTQ. Téléchargez le logiciel sur les pages d’assistance du logiciel de conversion bcl2fastq du site Web d’Illumina. Nom et emplacement du dossier de sortie Pour chaque analyse, le logiciel de commande génère automatiquement un dossier de sortie et un dossier d’analyse.
-
Page 53: Flux De Travail De Real-Time Analysis
Guide du système de séquençage iSeq 100 Structure du dossier de sortie Recipe : fichier de formule propre à l’analyse. Logs : fichiers de journaux décrivant les étapes des analyses sur l’instrument, les étapes de fonctionnement et d’autres événements. Config : paramètres de configuration de l’analyse. RunParameters.xml RunInfo.xml CopyComplete.txt... - Page 54 Guide du système de séquençage iSeq 100 Extraction des intensités La fonction d’extraction des intensités calcule une valeur d’intensité pour chaque nanopuits dans une image donnée. Correction de la mise en phase Lors de la réaction de séquençage, chaque brin d’ADN dans un amplifiat s’étend d’une base par cycle. La mise en phase et la mise en préphase ont lieu lorsqu’un brin est déphasé...
- Page 55 Guide du système de séquençage iSeq 100 Figure 10 Visualisation de l’intensité des amplifiats Tableau 3 Définition des bases dans le séquençage à un seul marqueur Marqueur à la Marqueur à la Base Conclusion de la comparaison des images première image deuxième image Les amplifiats montrant une intensité dans les deux images sont des bases T.
- Page 56 (préférablement sur les deux) pour chaque cycle. La disposition de la plaque et les séquences fournies avec IDT pour les index TruSeq UD pour Illumina sont conçues pour procurer le bon équilibre.
-
Page 57: Annexe B Dépannage
Annexe B Dépannage Résolution des messages d’erreur Arrêter une analyse en cours Mettre l’instrument hors tension et le redémarrer Réaliser une vérification du système Réduction des problèmes de fuite Restaurer les paramètres initiaux Résolution des messages d’erreur Cet annexe présente des directives détaillées pour les différentes procédures de dépannage. L’organigramme suivant présente le flux de travail de la résolution des messages d’erreur qui s’affichent au cours de l’initialisation, de la configuration de l’analyse, des vérifications avant analyse ou du séquençage, et qui ne sont pas résolus par une nouvelle tentative. -
Page 58: Arrêter Une Analyse En Cours
Guide du système de séquençage iSeq 100 Arrêter une analyse en cours Après le début d’une analyse, vous pouvez l’arrêter, éjecter la cartouche et retourner à l’écran Sequence (Séquencer). ATTENTION L’annulation d’une analyse est définitive. Après la vérification de l’instrument dans le cadre des vérifications avant analyse, le logiciel ne peut pas reprendre l’analyse et les consommables ne peuvent pas être réutilisés. - Page 59 Guide du système de séquençage iSeq 100 Lorsque le bouton de mise en marche clignote, appuyez sur l’interrupteur situé sur le panneau arrière pour arrêter l’instrument (position O). Le bouton de mise en marche peut clignoter encore même si l’appareil est éteint. Figure 12 Emplacement de l’interrupteur Attendez 30 secondes.
-
Page 60: Réaliser Une Vérification Du Système
Guide du système de séquençage iSeq 100 Réaliser une vérification du système La vérification du système dure environ 45 minutes et utilise la Flow Cell d’essai et la cartouche d’essai réutilisables pour résoudre les problèmes survenus lors de la vérification avant analyse et d’autres erreurs. Quatre essais des sous-systèmes confirment le bon alignement et le bon fonctionnement des composants. -
Page 61: Réduction Des Problèmes De Fuite
Il pourrait y avoir un problème matériel Communiquez avec l’assistance échoué avec l’instrument. technique d’Illumina. 12 Sélectionnez Unload (Décharger) pour éjecter la cartouche d’essai réutilisable. 13 Retirez la cartouche d’essai réutilisable du plateau. 14 Sortez la Flow Cell d’essai réutilisable de la cartouche. - Page 62 Après le nettoyage, la vérification du système confirme le fonctionnement normal. Fermez et déconnectez l’instrument de la façon suivante s’il y a une quantité importante de fluides sur la Flow Cell, la cartouche ou l’instrument. Communiquez ensuite avec l’assistance technique d’Illumina. Dans le menu, sélectionnez Shut Down System (Arrêter le système).
- Page 63 Mettez le tampon et les autres consommables au rebut conformément aux normes en vigueur selon la région. Pour plus de renseignements, consultez la fiche signalétique (SDS) sur support.illumina.com/sds.html. Placez un nouveau tampon sur le plateau d’égouttage. Fermez le plateau d’égouttage, puis la porte du plateau d’égouttage.
-
Page 64: Restaurer Les Paramètres Initiaux
En restaurant les paramètres initiaux du système, vous retournerez à une version antérieure des logiciels, ferez disparaître toute configuration indésirable ou supprimerez les données de l’utilisateur avant de retourner l’instrument à Illumina. La restauration du système désinstalle le logiciel de commande et supprime les données du lecteur C. - Page 65 Téléchargez les programmes d’installation se trouvant sur les pages d’assistance de Local Run Manager. Enregistrez-les dans un emplacement réseau ou sur une clé USB. Faites une copie des programmes d’installation sur le lecteur C:\Illumina. d Ouvrez les programmes d’installation (*.exe), puis suivez les directives d’installation.
-
Page 66: Annexe C Échange Avancé
Puisque le filtre à air et le tampon du plateau d’égouttage sont les seules pièces réparables du système iSeq 100, Illumina utilise l’échange avancé pour régler les problèmes qui ne peuvent être résolus à distance. Le service d’échange avancé remplace un système endommagé ou défectueux par un système remis à neuf. - Page 67 L’emplacement des données de séquençage est défini par l’utilisateur, mais le lecteur D l’emplacement par défaut. Effacez tous les fichiers et dossiers que vous ne voulez pas partager avec Illumina. Éteignez le système comme suit : Dans le menu, sélectionnez Shut Down System (Arrêter le système).
- Page 68 Guide du système de séquençage iSeq 100 Décontaminer l’instrument La livraison d’un instrument nécessite la procédure de décontamination suivante dont la conclusion est confirmée par Illumina. Les dangers inhérents au site peuvent nécessiter une décontamination supplémentaire. Décontaminer avec de l’eau de Javel Enfilez une nouvelle paire de gants sans talc.
- Page 69 Mettez le tampon et les autres consommables au rebut conformément aux normes en vigueur selon la région. Pour plus de renseignements, consultez la fiche signalétique (SDS) sur support.illumina.com/sds.html. 10 Nettoyez le plateau d’égouttage avec une lingette imbibée d’eau de Javel. 11 Attendez 15 minutes que l’eau de Javel fasse effet.
- Page 70 Guide du système de séquençage iSeq 100 Retourner le système d’origine Emballer l’instrument Libérez l’espace adéquat dans le laboratoire pour l’instrument et l’emballage. Placez le petit protecteur en mousse entre le moniteur abaissé et l’instrument. Recouvrez l’instrument avec le sac de plastique gris. Abaissez le rabat avant de la boîte blanche.
- Page 71 Guide du système de séquençage iSeq 100 Placez les deux sacs refermables dans la boîte d’accessoires du système de séquençage iSeq 100. Fermez la boîte d’accessoires. Expédier le système Si elle a été retirée, placez la base protectrice en mousse au fond de la boîte d’expédition brune. Soulevez la boîte blanche par les poignées (il est recommandé...
- Page 72 10 Retournez l’instrument à Illumina par le service UPS. Si votre laboratoire effectue des livraisons quotidiennes avec UPS, donnez la boîte d’expédition étiquetée au conducteur. Dans le cas contraire, communiquez avec le service à la clientèle d’Illumina, qui organisera l’expédition pour vous. Document nº 1000000036024 v05 FRA...
- Page 73 % d’occupation 21, 30, 33 arrêter les analyses 50 % PF 21, 30, 33, 47 assistance clientèle 71 assistance de Windows 10 18 assistance Illumina Proactive 13-14 assistance technique 71 avertissements 6, 45, 50 abonnements Entreprise 14 accès à distance 27 adaptateurs d’index i5 32...
- Page 74 Guide du système de séquençage iSeq 100 compte utilisateur 12 dossier de sortie 7, 29, 32, 35, 43 concentrations de chargement 21, 24 accès 13 concentrations de départ 23 emplacement par défaut 17, 44 conditions de stockage 7, 10 dossier de sortie par défaut 17, 29 configuration de l’analyse droits, compte administrateur 41 écrans 27, 30...
- Page 75 35 lectures 32 téléchargements 35 séquences d’adaptateurs 47 logiciel index TruSeq UD avec IDT pour Illumina 47 compatibilité des réactifs 7 indicateurs de rendement 30, 33 mise à jour des paramètres 16 indicateurs du rendement total attendu 30, 33...
- Page 76 Guide du système de séquençage iSeq 100 lunettes de protection 22 orientations de l’index 2 30 orientations de l’index i5 30 manifeste d’échantillons 45 mesures de la pureté 47 pages d’assistance, site Web 35 méthodes de normalisation 23 paramètres microtubes à faible adhérence 23 configuration initiale 12 miniatures 17 modification 13-14...
- Page 77 1 retours contrôle 25 délais 58 trousse d’essai 20 documents 58 trousse d’essai du système iSeq 100 20, 52 étiquettes 63 trousses 7, 19 réussite de la vérification du système 52 numéros de référence 20 RFID 2, 7 trousses de préparation de librairies 1, 21 RunInfo.xml 43...
- Page 78 Guide du système de séquençage iSeq 100 WiFi, mise en marche 18 Windows comptes 12 ouverture de session 39, 51, 56 paramètres 18 sécurité 40 Document nº 1000000036024 v05 FRA Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
- Page 79 00806651752 Autres pays +44 1799 534000 Fiches signalétiques (SDS) : disponibles sur le site Web d’Illumina à l’adresse support.illumina.com/sds.html. Documentation produit : disponible en téléchargement au format PDF sur le site Web d’Illumina. Rendez-vous sur support.illumina.com, sélectionnez un produit, puis cliquez sur Documentation & Literature (Documentation).
- Page 80 Document nº 1000000036024 v05 FRA Illumina 5200 Illumina Way San Diego, CA 92122 États-Unis +(1) 800 809-ILMN (4566) +(1) 858 202-4566 (en dehors de l’Amérique du Nord) techsupport@illumina.com www.illumina.com Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic. © 2019 Illumina, Inc. Tous droits réservés.