Notice relative à l'instrument NovaSeq 6000Dx
Figure 12 Mise en phase et en préphase
A. Lecture avec une base présentant une mise en phase
B. Lecture avec une base présentant une mise en préphase.
RTA3 corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase, ce qui maximise la qualité des données à
chaque cycle tout au long de l'analyse.
Définition des bases
La définition des bases détermine une base (A, C, G ou T) pour chaque amplifiat d'une plaque donnée d'un cycle
spécifique. Le Instrument NovaSeq 6000Dx utilise un séquençage à deux canaux, qui ne nécessite que deux
images pour encoder les données de quatre bases d'ADN, une provenant du canal rouge et une autre du canal
vert.
L'absence de définition est indiquée par la lettre N. Il n'y a aucune définition lorsqu'un amplifiat ne passe pas le
filtre, que l'enregistrement échoue ou que l'amplifiat se trouve hors de l'image.
Les intensités de chaque amplifiat sont extraites de l'image rouge et de l'image verte, puis sont comparées l'une
à l'autre, ce qui donne quatre populations distinctes. Chaque population correspond à une base. Le processus
de définition des bases détermine à quelle population appartient chaque amplifiat.
Figure 13 Visualisation de l'intensité des amplifiats
Document n°200025276 v01
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
POUR EXPORTATION UNIQUEMENT
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