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Notice relative à l'instrument NovaSeq 6000Dx
Sorties RTA3
Les images de chaque canal de couleur passent de la mémoire à RTA3 sous forme de plaques. À l'aide de ces
images, RTA3 produit un ensemble de fichiers de filtrage et de fichiers de définition des bases dont la qualité
est notée. Toutes les autres données de sortie sont des données complémentaires des principaux fichiers de
sortie.
Type de fichiers
Fichiers de définition
des bases
Fichiers de filtrage
RTA3 donne des mesures en temps réel sur la qualité de l'analyse, stockées dans des fichiers InterOp, qui sont
des fichiers de sortie binaires contenant des mesures relatives aux plaques, aux cycles et au niveau de lecture.
Gestion des erreurs
RTA3 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier Logs (Journaux). Les erreurs sont
enregistrées dans un format de fichier texte (*.log).
Les fichiers journaux suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du traitement :
•
info_00000.log résume les activités d'analyse importantes.
•
error_00000.log répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
•
warning_00000.log répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
Plaques de la Flow Cell
Les plaques sont de petites zones d'imagerie sur la Flow Cell. La caméra prend une image de chaque témoin,
que le logiciel divise en plaques aux fins du traitement par RTA3. Le nombre total de plaques dépend du nombre
de lignes, de témoins et de surfaces qui sont imagés sur la Flow Cell.
•
Les Flow Cell S2 possèdent un total de 1 408 plaques.
Les Flow Cell S4 possèdent un total de 3 744 plaques.
•
Composants de la
Flow Cell
Lignes
Document n°200025276 v01
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
POUR EXPORTATION UNIQUEMENT
Description
Chaque plaque analysée est incluse dans un fichier de définition des bases
concaténé (*.cbcl). Les plaques de la même ligne et de la même surface sont
rassemblées dans un fichier CBCL pour chacune des lignes et des surfaces.
Chaque plaque produit un fichier de filtrage (*.filter) qui précise si un amplifiat a
franchi les filtres.
S2
S4
Description
2
4
Une ligne est un canal physique possédant des ports d'entrée et
de sortie.
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