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Notice relative à l'instrument NovaSeq 6000Dx
Fichiers de sortie de séquençage
Type de fichiers
Fichiers de définition
des bases
Fichiers
d'emplacement des
amplifiats
Fichiers de filtrage
Fichier de
renseignements sur
l'analyse
Fichiers des
miniatures
Structure des dossiers de sortie de séquençage
Le NVOS génère automatiquement le nom du dossier de sortie.
Config : paramètres de configuration de l'analyse.
Logs : fichiers journaux décrivant les étapes de fonctionnement, les étapes des analyses sur l'instrument et
les évènements de RTA3.
SampleSheet.csv : feuille d'échantillon ou autre fichier joint, le cas échéant.
Data (Données)
Intensities (Intensités)
BaseCalls (Définitions de bases)
Document n°200025276 v01
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
POUR EXPORTATION UNIQUEMENT
Description, emplacement et nom des fichiers
Chaque amplifiat analysé est compris dans un fichier de définition des bases ; ces
fichiers sont rassemblés dans un fichier pour chaque cycle, chaque ligne et chaque
surface. Le fichier rassemblé contient la définition des bases ainsi que le score de
qualité codé associé à chaque amplifiat.
Data\Intensities\BaseCalls\L001\C1.1
L[lane]_[surface].cbcl, par exemple L001_1.cbcl
Pour chaque Flow Cell, un fichier d'emplacement des amplifiats binaire comprend les
coordonnées XY des amplifiats sur la plaque. Une disposition hexagonale qui
concorde avec l'emplacement des nanopuits de la Flow Cell prédéfinit les
coordonnées.
Data\Intensities
s_[lane].locs
Le fichier de filtrage spécifie si un amplifiat a franchi les filtres. Les fichiers de filtrage
sont générés au cycle 26 et portent sur 25 cycles de données. Un fichier de filtrage
est généré pour chaque plaque.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
s_[lane]_[tile].filter
Indique le nom de l'analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, si la lecture est une
lecture d'index et le nombre de témoins et de plaques sur la Flow Cell. Le fichier de
renseignements sur l'analyse est créé au début de l'analyse.
[Root folder], RunInfo.xml
Images de miniatures du premier cycle de chaque séquençage.
Thumbnail_Images\L001\C[X.1] : les fichiers sont stockés dans un sous-dossier
pour chaque cycle.
s_[lane]_[tile]_[channel].jpg : l'image miniature comprend le numéro de la
plaque.
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