illumina iSeq 100 Guide
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Voir aussi pour iSeq 100:
- Manuel système (80 pages) ,
- Fiche d'installation (2 pages)
Manuels Connexes pour illumina iSeq 100
Sommaire des Matières pour illumina iSeq 100
- Page 1 Guide du système de séquençage Document nº 1000000036024 v07 FRA EXCLUSIF À ILLUMINA Avril 2020 Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
- Page 2 Guide du système de séquençage iSeq 100 Ce document et son contenu sont exclusifs à Illumina, Inc. et à ses sociétés affiliées (« Illumina »); ils sont exclusivement destinés à l’usage contractuel de son client dans le cadre de l’utilisation du ou des produits décrits dans les présentes et ne peuvent servir à...
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Page 3: Historique Des Révisions
Remplacement du réactif iSeq 100 i1 par les trousses suivantes : • Nº de référence Illumina 20031371 pour le réactif iSeq 100 i1 v2. • Nº de référence Illumina 20031374 pour le réactif iSeq 100 i1 v2 pour le paquet de quatre. Ajout d’informations sur la compatibilité des logiciels et des réactifs. - Page 4 2019 d’eau, une cartouche doit être rangée à une température comprise entre -25 °C et -15 °C pendant au moins 1 journée. Correction du terme Librairie AmpliSeq pour Illumina PLUS pour Librairie PLUS AmpliSeq pour Illumina. Document nº 1000000036024 v07 FRA Destiné à la recherche uniquement.
- Page 5 • Mise hors tension et redémarrage de l’instrument lors de la restauration aux paramètres initiaux. Renvoi aux Séquences des adaptateurs Illumina (document nº 1000000002694) afin de déterminer les bonnes orientations de l’index 2 (i5) pour une feuille échantillons. Ajout de précisions aux points suivants : •...
- Page 6 • Ajout de renseignements sur l’indicateur du taux d’occupation. • Augmentation à 50 µl du volume de contrôle PhiX 1 nmol lors de l’ajout d’une substance de contrôle. Mise à jour des numéros de référence d’Illumina pour les composants suivants : • Tampon de rechange pour plateau d’égouttage iSeq 100, nº 20023927.
- Page 7 Guide du système de séquençage iSeq 100 Document Date Description des modifications Mise à jour des recommandations sur les pipettes et les pointes de pipettes. Ajout des diverses directives suivantes : • Exécution d’analyses de validation. • Création d’une feuille d’échantillons lors du séquençage en mode manuel.
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Page 8: Table Des Matières
Table des matières Chapitre 1 Vue d’ensemble Introduction Ressources supplémentaires Composants de l’instrument Réactif i1 iSeq 100 Chapitre 2 Pour commencer Configuration initiale Réduire la fenêtre du logiciel de commande Paramètres de l’analyse Personnalisation des instruments Configuration réseau Consommables et équipement fournis par l’utilisateur Chapitre 3 Séquençage Introduction Décongeler la cartouche ensachée... - Page 9 Guide du système de séquençage iSeq 100 Recevoir un système de remplacement Préparer le système d’origine pour le retour Retourner le système d’origine Index Assistance technique Document nº 1000000036024 v07 FRA Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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Page 10: Chapitre 1 Vue D'ensemble
Le système de séquençage iSeq 100 d’Illumina présente une approche ciblée pour le séquençage nouvelle génération (SNG). Ce système axé sur les applications offre la technologie de séquençage d’Illumina dans un instrument de bureau économique. Fonctionnalités Accessibilité et fiabilité : le système iSeq 100 est compact, et facile à installer et à utiliser. Les composants fluidiques et d’imagerie sont intégrés à... -
Page 11: Ressources Supplémentaires
Les pages d’assistance du système de séquençage iSeq 100 sur le site Web d’Illumina comprennent des ressources additionnelles concernant le système. Ces ressources comprennent des logiciels, des documents de formation, les produits compatibles et les documents ci-dessous. Consultez régulièrement les pages d’assistance pour voir la plus récente version de ces documents. -
Page 12: Composants De L'instrument
Guide du système de séquençage iSeq 100 Ressource Description Guide de conformité du lecteur Fournit des renseignements sur le lecteur RFID de l’instrument, y compris les RFID (document certificats de conformité et les questions de sécurité. nº 1000000002699) Composants de l’instrument Le système de séquençage iSeq 100 comporte un bouton de mise en marche, un écran, une barre d’état, un compartiment destiné... -
Page 13: Compartiment Des Consommables
Guide du système de séquençage iSeq 100 REMARQUE La connexion du système à un clavier et à une souris désactive le clavier à l’écran. Figure 3 Composants du panneau arrière A Port Ethernet : connexion facultative du câble Ethernet. B Ports USB : deux ports pour la connexion des composants auxiliaires. C Interrupteur : mise en marche ou arrêt de l’instrument. -
Page 14: Cartouche Et Flow Cell D'essai Réutilisables
Guide du système de séquençage iSeq 100 Cartouche et Flow Cell d’essai réutilisables L’instrument est livré avec la Flow Cell d’essai réutilisable iSeq 100 et une cartouche d’essai réutilisable iSq 100 qui servent aux vérifications du système. Conservez-les dans leur emballage d’origine, à température ambiante, et utilisez-les jusqu’à... -
Page 15: Information Sur Le Système
Manager et le logiciel de commande peuvent nécessiter des entrées de l’utilisateur. Information sur le système Le menu du logiciel de commande comporte une section About (À propos) où se trouvent les coordonnées d’Illumina ainsi que l’information suivante sur le système : Numéro de série Nom de l’ordinateur et l’adresse IP Version des fragments de formule Nombre d’analyses... -
Page 16: État De Universal Copy Service
Guide du système de séquençage iSeq 100 Pour résoudre les problèmes relatifs à l’état de l’analyse, consultez la section État de la gestion du processus à la page 46. Pour effacer les analyses et libérer de l’espace, consultez la section Libérer de l’espace sur le disque dur à... - Page 17 Guide du système de séquençage iSeq 100 Quantité Composant Température de stockage Paquet de quatre Cartouche -25 à -15 °C Flow Cell 2 à 8 °C* Paquet de huit Cartouche -25 à -15 °C Flow Cell 2 à 8 °C* *Livrée à la température ambiante. Lorsque vous recevez votre réactif iSeq 100 i1 v2, stockez rapidement ses composants à la température indiquée afin de garantir sa performance : Entreposez le réactif à...
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Page 18: Compatibilité Du Logiciel
Guide du système de séquençage iSeq 100 Cartouche La cartouche iSeq 100 i1 est préremplie de réactifs de génération d’amplifiats, de réactifs de séquençage, de réactifs pour bases appariées et de réactifs d’indexage. Un réservoir recouvert d’un opercule en aluminium est réservé aux librairies, et une fente située à l’avant est réservée à la Flow Cell. La lumière de l’illuminateur atteint la Flow Cell par une fenêtre d’accès dans le haut de la cartouche. -
Page 19: Légende Des Symboles
Indique quel côté doit être orienté vers le haut pendant le sockage. Date de péremption du consommable. Pour de meilleurs résultats, utilisez le consommable avant cette date. Fabricant de l’instrument (Illumina). Date de fabrication du consommable. Le consommable est destiné à la recherche uniquement. -
Page 20: Chapitre 2 Pour Commencer
Chapitre 2 Pour commencer Configuration initiale Réduire la fenêtre du logiciel de commande Paramètres de l’analyse Personnalisation des instruments Configuration réseau Consommables et équipement fournis par l’utilisateur Configuration initiale À la première mise en marche du système, le logiciel de commande est lancé et affiche une série d’écrans pour vous guider tout au long de votre première configuration. -
Page 21: Paramètres De L'analyse
L’activation de l’Assistance Illumina Proactive envoie les données de performance des instruments (pas les données de séquençage) à BaseSpace Sequence Hub. Pour obtenir plus de renseignements, consultez la note technique d’Illumina Proactive (document nº 1000000052503). -
Page 22: Configurer Manuellement Les Paramètres
Pour le désactiver, décochez la case Turn on Illumina Proactive Support (Activer le support proactif d’Illumina. Le service envoie à Illumina des données sur les performances des instruments, telles que la température et la durée de fonctionnement. Ces données aident Illumina à détecter les défaillances potentielles et à... -
Page 23: Exigences Relatives Aux Feuilles D'échantillons
Pour le système de séquençage iSeq 100, saississez les séquences des adaptateurs de l’index 2 (i5) dans la bonne orientation. Pour les orientations de l’index, consultez le document sur les séquences des adaptateurs Illumina (document nº 1000000002694). Une feuille d’échantillons est aussi requise lorsque le système est configuré en mode Local Run Manager. -
Page 24: Personnalisation Des Instruments
Guide du système de séquençage iSeq 100 Personnalisation des instruments Nommez votre instrument et configurez les paramètres pour l’audio, les images miniatures et les mises à jour logicielles dans l’onglet Customization (Personnalisation) des paramètres du système. Nommer l’instrument Dans le menu du logiciel de commande, sélectionnez System Settings (Paramètres du système). Sélectionnez l’onglet Customization (Personnalisation). -
Page 25: Configuration Réseau
Guide du système de séquençage iSeq 100 Sélectionnez l’onglet Customization (Personnalisation). Choisissez si le système doit vérifier automatiquement la disponibilité des mises à jour logicielles : Pour une vérification automatique, cochez Autocheck for software updates (Vérification automatique des mises à jour logicielles). Pour une vérification manuelle, décochez la case Autocheck for software updates (Vérification automatique des mises à... -
Page 26: Se Connecter À Internet
Guide du système de séquençage iSeq 100 Network Account (Compte réseau) : le dossier de sortie est situé dans un répertoire nécessitant des identifiants de connexion. Ce paramètre s’applique à l’emplacement par défaut du dossier de sortie et tout autre emplacement précisé pendant la configuration de l’analyse. Si vous sélectionnez Network Account (Compte réseau), saisissez le nom de l’utilisateur et le mot de passe du compte. -
Page 27: Consommables Et Équipement Fournis Par L'utilisateur
Dilution et chargement des librairies. Pointes de pipette, 100 µl Fournisseur de laboratoire général Dilution et chargement des librairies. Tampon de resuspension Illumina, fourni avec les trousses de Dilution des librairies selon la concentration de préparation de librairies chargement. [Facultatif] Tris-HCl 10 mM, Fournisseur de laboratoire général... -
Page 28: Équipement
Guide du système de séquençage iSeq 100 Consommable Fournisseur Utilisation Essuie-tout Fournisseur de laboratoire Essuyage des fluides autour de l’instrument. général [Facultatif] Solution d’eau de VWR, nº de référence 16003- Nettoyage des surfaces après la décontamination. Javel à 10 % 740 (32 oz), 16003-742 (16 oz), ou équivalent [Facultatif] Lingettes... -
Page 29: Chapitre 3 Séquençage
Type de librairie Concentration de chargement (pmol) 100 % contrôle PhiX (analyses incluant uniquement le contrôle PhiX) Librairie PLUS AmpliSeq pour Illumina 40 à 60 ADN Flex Nextera 75 à 125 Flex Nextera pour l’enrichissement 50 à 100 ADN XT Nextera... -
Page 30: Nombre De Cycles Recommandés
Guide du système de séquençage iSeq 100 Une concentration de chargement de départ de 50 pmol est recommandée par Illumina pour les autres types de librairies. Optimisez cette concentration au fil des analyses afin de déterminer une concentration de chargement produisant constamment des données conformes aux spécifications. -
Page 31: Préparer La Flow Cell Et Les Librairies
PhiX. Les librairies sont automatiquement dénaturées sur l’instrument. Les directives de dilution s’appliquent aux librairies double brin Illumina prises en charge. Effectuez toujours une analyse de contrôle qualité, optimisez la concentration de chargement pour votre librairie et utilisez une méthode de normalisation qui génère des librairies double brin. -
Page 32: Diluer La Librairie À 1 Nmol
Dans un microtube à faible adhérence, diluez la librairie 1 nmol dans le tampon de RSB au volume applicable : Type de librairie Volume de la librairie 1 nmol (µl)* 100 % contrôle PhiX (analyses incluant uniquement le contrôle PhiX) Librairie PLUS AmpliSeq pour Illumina ADN Flex Nextera Flex Nextera pour l’enrichissement ADN XT Nextera TruSeq DNA Nano ADN sans PCR TruSeq... -
Page 33: Ajouter Un Contrôle Phix (Facultatif)
Ajouter un contrôle PhiX (facultatif) Le contrôle PhiX est une petite librairie Illumina prête à utiliser comportant une représentation équilibrée des nucléotides. L’ajout de 2 % de substance de contrôle PhiX à votre librairie fournit des indicateurs supplémentaires. En ce qui concerne les librairies à faible diversité, utiliser une substance de contrôle de 10 % pour augmenter la diversité. -
Page 34: Charger Les Consommables Dans La Cartouche
Guide du système de séquençage iSeq 100 Agitez brièvement, puis centrifugez à 280 × g pendant 1 minute. Conservez la librairie avec la substance de contrôle PhiX sur de la glace. Charger les consommables dans la cartouche [Facultatif] Pour visionner une vidéo d’instructions expliquant la préparation et le chargement de la cartouche, sélectionnez Sequence (Séquencer). - Page 35 Guide du système de séquençage iSeq 100 Sortez la Flow Cell de l’emballage. Touchez seulement au plastique lorsque vous manipulez une Flow Cell. Évitez de toucher à l’interface électrique, au capteur CMOS, à la partie en verre et aux joints situés de chaque côté de la partie en verre. Tenez la Flow Cell par les points de préhension en vous assurant que l’étiquette est orientée vers le haut.
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Page 36: Configurer Une Analyse De Séquençage (Local Run Manager)
Guide du système de séquençage iSeq 100 Configurer une analyse de séquençage (Local Run Manager) La configuration d’une analyse à l’aide de Local Run Manager comprend la création et l’enregistrement de l’analyse dans Local Run Manager, puis le retour au logiciel de commande pour charger les consommables et sélectionner l’analyse. -
Page 37: Ouvrir Une Session De Basespace Sequence Hub
Pour déconnecter l’analyse en cours de BaseSpace Sequence Hub, sélectionnez Skip BaseSpace Sequence Hub Sign In (Sauter l’ouverture de session de BaseSpace Sequence Hub). Les données de performance de l’instrument sont tout de même envoyées à Illumina. Pour modifier la connectivité pour l’analyse en cours, sélectionnez une option de configuration Run Monitoring Only (Surveillance de l’analyse seulement) : envoyer seulement les fichiers InterOp à... -
Page 38: Examiner Les Vérifications Avant Analyse
Guide du système de séquençage iSeq 100 Pour modifier l’emplacement du dossier de sortie de l’analyse en cours, saisissez le chemin pour l’emplacement ou sélectionnez Browse (Parcourir) pour naviguer jusqu’à l’emplacement voulu. d Sélectionnez Save (Enregistrer), pour mettre à jour l’analyse dans le logiciel de commande et dans Local Run Manager. -
Page 39: Configurer Une Analyse De Séquençage (Mode Manuel)
Modifiez le modèle selon vos besoins. Vérifiez les points suivants : Les séquences des adaptateurs de l’index 2 (i5) sont orientées dans la bonne direction. Pour voir les orientations, consultez le document sur les séquences des adaptateurs Illumina (document nº 1000000002694). Les valeurs de la feuille d’échantillons correspondent aux valeurs du logiciel de commande. Par exemple, entrez 151 dans le champ de la lecture 1 sur la feuille d’échantillons et à... -
Page 40: Saisir Les Paramètres De L'analyse
Pour déconnecter l’analyse en cours de BaseSpace Sequence Hub, sélectionnez Skip BaseSpace Sequence Hub Sign In (Sauter l’ouverture de session de BaseSpace Sequence Hub). Les données de performance de l’instrument sont tout de même envoyées à Illumina. Pour modifier la connectivité pour l’analyse en cours, sélectionnez une option de configuration Run Monitoring Only (Surveillance de l’analyse seulement) : envoyez seulement les fichiers InterOp à... - Page 41 Guide du système de séquençage iSeq 100 Single Read (Lecture unique) : exécution d’une seule lecture de séquençage; cette option est la plus rapide et la plus simple. Paired End (Lecture appariée) : exécution de deux lectures de séquençage; cette option génère des données de meilleure qualité et un alignement plus précis. Dans le champ Read Cycle (Cycle de lecture), saisissez le nombre de cycles à...
- Page 42 éliminez-les conformément aux lois et règles régionales, nationales et locales en vigueur. Pour obtenir des renseignements supplémentaires sur l’environnement, la santé et la sécurité, consultez la fiche signalétique sur support.illumina.com/sds.html. Sélectionnez Close Door (Fermer la porte) pour recharger le plateau et retourner à l’écran d’accueil.
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Page 43: Chapitre 4 Maintenance
Chapitre 4 Maintenance Libérer de l’espace sur le disque dur Mises à jour logicielles Remplacer le filtre à air Déplacer l’instrument Libérer de l’espace sur le disque dur Une analyse de séquençage nécessite un espace d’environ 2 Go sur le disque dur. Lorsqu’il reste peu d’espace sur le disque dur, suivez les étapes ci-dessous pour effacer les analyses terminées et libérer de l’espace. -
Page 44: Installer Automatiquement Une Mise À Jour Logicielle
Guide du système de séquençage iSeq 100 Installer automatiquement une mise à jour logicielle Passez au compte du système d’exploitation sbsadmin. Sélectionnez le menu du logiciel de commande, puis Software Update (Mise à jour logicielle) pour ouvrir la boîte de dialogue de la mise à jour logicielle. Les systèmes configurés pour les mises à... -
Page 45: Remplacer Le Filtre À Air
L’instrument est livré avec un filtre à air déjà installé, et un filtre à air de rechange. Des filtres à air de rechange sont compris avec la garantie; vous pouvez aussi vous en procurer auprès d’Illumina. Six mois après la configuration initiale, et tous les six mois par la suite, le logiciel indique qu’il est temps de remplacer le filtre à... - Page 46 Guide du système de séquençage iSeq 100 Retirez le panneau de l’instrument. Retirez le filtre à air en mousse du centre du panneau et jetez-le. Insérez un nouveau filtre à air dans le panneau en appuyant pour vous assurer qu’il reste en place. Insérez les deux crochets du panneau dans les trous réservés à...
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Page 47: Déplacer L'instrument
Guide du système de séquençage iSeq 100 Déplacer l’instrument Utilisez les instructions suivantes pour déplacer l’instrument de façon sécuritaire. Assurez-vous que le nouvel emplacement respecte les exigences décrites dans le Guide de préparation du site du système de séquençage iSeq 100 (document nº 1000000035337). Si vous retournez un instrument, passez la présente section et consultez la section Service d’Échange avancé... - Page 48 Guide du système de séquençage iSeq 100 12 Lorsque le bouton de mise en marche clignote, appuyez dessus. Figure 8 Emplacement du bouton de mise en marche 13 Lorsque le système d’exploitation est lancé, connectez-vous à Windows. Le logiciel de commande démarre et initialise le système. L’écran d’accueil apparaît lorsque l’initialisation est terminée.
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Page 49: Annexe A Sortie De Séquençage
Annexe A Sortie de séquençage Présentation de Real-Time Analysis Flux de travail de Real-Time Analysis Présentation de Real-Time Analysis Le logiciel Real-Time Analysis s’exécute sur l’ordinateur de commande de l’instrument. Pendant une analyse de séquençage, il extrait les intensités des images pour effectuer la définition des bases et associer un score de qualité... -
Page 50: Nom Et Emplacement Du Dossier De Sortie
Téléchargez le logiciel sur les pages d’assistance du logiciel de conversion bcl2fastq sur le site Web d’Illumina. Nom et emplacement du dossier de sortie Pour chaque analyse, le logiciel de commande génère automatiquement un dossier de sortie et un dossier d’analyse. -
Page 51: Gestion Des Erreurs
Guide du système de séquençage iSeq 100 Structure du dossier de sortie Recipe (Formule) : fichier de formule propre à l’analyse. Logs (Journaux) : les fichiers de journaux décrivent les étapes des analyses sur l’instrument, les étapes de fonctionnement et d’autres événements. Config : paramètres de configuration de l’analyse. RunParameters.xml RunInfo.xml CopyComplete.txt... -
Page 52: Extraction Des Intensités
Guide du système de séquençage iSeq 100 Extraction des intensités La fonction d’extraction des intensités calcule une valeur d’intensité pour chaque nanopuits dans une image donnée. Correction de la mise en phase Lors de la réaction de séquençage, chaque brin d’ADN dans un amplifiat s’étend d’une base par cycle. La mise en phase et la mise en préphase ont lieu lorsqu’un brin est déphasé... -
Page 53: Amplifiats Passant Le Filtre
Guide du système de séquençage iSeq 100 Figure 10 Visualisation de l’intensité des amplifiats Tableau 1 Définition des bases dans le séquençage à un seul marqueur Marqueur à la Marqueur à la Base Conclusion de la comparaison des images première image seconde image Les amplifiats montrant une intensité dans les deux images sont des bases T. -
Page 54: Notation De La Qualité
(préférablement sur les deux) pour chaque cycle. La disposition de la plaque et les séquences fournies avec IDT pour les index TruSeq UD pour Illumina sont conçues pour procurer le bon équilibre. -
Page 55: Annexe B Dépannage
Annexe B Dépannage Résolution des messages d’erreur Annuler une analyse lancée Mettre l’instrument hors tension et le redémarrer Réaliser une vérification du système Réduction des problèmes de fuite Restaurer les paramètres initiaux Résolution des messages d’erreur Cette annexe présente des directives détaillées pour les différentes procédures de dépannage. L’organigramme suivant présente le flux de travail des messages d’erreur qui s’affichent au cours de l’initialisation, de la configuration de l’analyse, des vérifications avant analyse ou du séquençage, et qu’une nouvelle tentative ne parvient pas à... -
Page 56: Annuler Une Analyse Lancée
Guide du système de séquençage iSeq 100 Annuler une analyse lancée Après le lancement d’une analyse, vous pouvez l’annuler pour mettre fin à l’analyse, éjecter la cartouche et revenir à l’écran Séquence. ATTENTION L’annulation d’une analyse est définitive. Après la vérification de l’instrument dans le cadre des vérifications avant analyse, le logiciel ne peut pas reprendre l’analyse et les consommables ne peuvent pas être réutilisés. -
Page 57: Réaliser Une Vérification Du Système
Guide du système de séquençage iSeq 100 Figure 12 Emplacement de l’interrupteur Attendez 30 secondes. Appuyez sur l’interrupteur pour mettre l’instrument en marche (position I). Lorsque le bouton de mise en marche clignote, appuyez dessus. Figure 13 Emplacement du bouton de mise en marche Lorsque le système d’exploitation est lancé, connectez-vous à... - Page 58 Guide du système de séquençage iSeq 100 Retirez la Flow Cell d’essai et la cartouche d’essai réutilisables de leur lieu de stockage à température ambiante. Dans le menu du logiciel de commande, sélectionnez System Check (Vérification du système). La boîte de dialogue System Check (Vérification du système) apparaît lorsque vous sélectionnez le test mécanique, thermique ou optique, ou le test des capteurs.
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Page 59: Réduction Des Problèmes De Fuite
éliminez-les conformément aux lois et règles régionales, nationales et locales en vigueur. Pour obtenir des renseignements supplémentaires sur l’environnement, la santé et la sécurité, consultez la fiche signalétique sur support.illumina.com/sds.html. Suivez les directives à l’écran pour éjecter la cartouche. -
Page 60: Nettoyer L'instrument
Après le nettoyage, la vérification du système confirme le fonctionnement normal. Fermez et déconnectez l’instrument de la façon suivante s’il y a une quantité importante de fluides sur la Flow Cell, la cartouche ou l’instrument. Communiquez ensuite avec l’assistance technique d’Illumina. Dans le menu, sélectionnez Shut Down System (Arrêter le système). -
Page 61: Restaurer Les Paramètres Initiaux
En restaurant les paramètres initiaux du système, vous retournerez à une version antérieure des logiciels, ferez disparaître toute configuration indésirable ou supprimerez les données de l’utilisateur avant de retourner l’instrument à Illumina. La restauration du système désinstalle le logiciel de commande et supprime les données du lecteur C:\. - Page 62 Sauvegardez le programme d’installation dans un emplacement réseau ou sur une clé USB. b Faites une copie des programmes d’installation sur le lecteur C:\Illumina. Ouvrez iSeqSuiteInstaller.exe, puis suivez les directives d’installation. d Une fois la mise à jour terminée, sélectionnez Finish (Terminer).
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Page 63: Annexe C Service D'échange Avancé
Puisque le filtre à air et le tampon du plateau d’égouttage sont les seules pièces réparables du système iSeq 100, Illumina utilise l’Échange avancé pour régler les problèmes qui ne peuvent être résolus à distance. Le service d’Échange avancé remplace un système endommagé ou défectueux par un système remis à... -
Page 64: Préparer Le Système D'origine Pour Le Retour
Guide du système de séquençage iSeq 100 Préparer le système d’origine pour le retour Retournez le système d’origine, la cartouche d’essai réutilisable et la Flow Cell d’essai réutilisable à Illumina dans les 30 jours suivant la réception de l’instrument de remplacement. Effacer les données et éteindre le système Si le système est activé, enregistrez et effacez les données comme suit. -
Page 65: Décontaminer L'instrument
Décontaminer l’instrument La livraison d’un instrument nécessite la procédure de décontamination suivante dont la conclusion est confirmée par Illumina. Les systèmes fonctionnant dans un laboratoire de niveau de biosécurité 2 ou 3 et les dangers propres au site peuvent nécessiter une décontamination supplémentaire. -
Page 66: Nettoyer Avec De L'alcool
S’il y a des traces de liquide au fond du plateau, asséchez-les à l’aide d’essuie-tout. Mettez le tampon et les autres consommables au rebut conformément aux normes régionales. Pour plus de renseignements, consultez la fiche signalétique (SDS) sur support.illumina.com/sds.html. 10 Nettoyez le plateau d’égouttage avec une lingette imbibée d’eau de Javel. -
Page 67: Retourner Le Système D'origine
Guide du système de séquençage iSeq 100 Nettoyez de nouveau les composants suivants avec une lingette alcoolisée : le plateau d’égouttage; la porte du compartiment de la cartouche (l’intérieur et l’extérieur, y compris les charnières). L’alcool sert à enlever les résidus d’eau de Javel pouvant causer de la corrosion. Assurez-vous de refermer le plateau d’égouttage et le compartiment de la cartouche. -
Page 68: Emballer Les Composants D'essai Réutilisables
Guide du système de séquençage iSeq 100 Fermez le rabat avant, puis le dessus de la boîte. Emballer les composants d’essai réutilisables Mettez la cartouche d’essai réutilisable iSeq 100 dans le plus grand sac refermable, puis fermez-le. Mettez la Flow Cell d’essai réutilisable iSeq 100 dans l’étui de protection. Mettez l’étui de protection dans le plus petit sac refermable, puis fermez-le. -
Page 69: Expédier Le Système
Placez la boîte d’accessoires au centre du couvercle protecteur en mousse. Placez le protecteur en mousse noir par-dessus la boîte d’accessoires. Si l’assistance technique d’Illumina vous demande de renvoyer le cordon d’alimentation, placez-le n’importe où dans la boîte brune. Refermez la boîte brune et scellez-la avec du ruban adhésif. - Page 70 10 Retournez l’instrument à Illumina par le service UPS. Si votre laboratoire effectue des livraisons quotidiennes avec UPS, donnez la boîte d’expédition étiquetée au conducteur. Dans le cas contraire, communiquez avec le service à la clientèle d’Illumina, qui organisera l’expédition pour vous. Document nº 1000000036024 v07 FRA Destiné...
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Page 71: Index
47 %Occupation 29, 33 assistance clientèle 68 %PF 20, 29, 33, 44 assistance de Windows 10 17 Assistance Illumina Proactive 12-13 assistance technique 68 avertissements 6, 42, 47 abonnements Entreprise 13 accès à distance 27 adaptateurs d’index i5 31 adaptateurs d’index i7 31... - Page 72 Guide du système de séquençage iSeq 100 compte utilisateur 11 dossier de sortie 7, 28, 31, 34, 40 concentrations de chargement 20 accès 11 concentrations de départ 23 emplacement par défaut 16, 41 conditions de stockage 7, 10 dossier de sortie par défaut 16, 28 configuration de l’analyse configuration des options 12-13 écrans 27, 30...
- Page 73 31 mettre à jour paramètres 16 séquences d’adaptateurs 44 paramètres de mise à jour 15 index TruSeq UD avec IDT pour Illumina 44 logiciel de conversion bcl2fastq 40 indicateurs de rendement 29, 33 logiciels initialisation 38, 48, 52 alertes de mise à...
- Page 74 Guide du système de séquençage iSeq 100 installation 34 orientations de l’index 2 30 version antérieure 52 orientations de l’index i5 30 longueurs de lecture 21 Lunettes de protection 21 pages d’assistance, site Web 34 paramètres manifeste d’échantillons 42 édition 13 mesures de pureté...
- Page 75 16 conception 1 réservoir de librairie 25 trousse d’essai 18 retour trousse d’essai du système iSeq 100 18, 48 étiquettes 60 trousses 7, 18 retours numéros de référence 18 documents 54 trousses de préparation de librairies 1, 20 limites 55 trousses de réactifs 7...
- Page 76 Guide du système de séquençage iSeq 100 résultats 48 version antérieure du logiciel 52 versions des logiciels 9 visualiseur d’analyse de séquençage 40 WiFi 17 WiFi, mise en marche 17 Windows comptes 11 ouverture de session 38, 48, 52 paramètres 17 Document nº 1000000036024 v07 FRA Destiné...
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Page 77: Assistance Technique
Taïwan, Chine 00806651752 Autres pays +44 1799 534 000 Fiches signalétiques (SDS) : disponibles sur le site Web d’Illumina à l’adresse support.illumina.com/sds.html. Documentation sur les produits : disponible en téléchargement sur le site support.illumina.com. Document nº 1000000036024 v07 FRA Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques. -
Page 78: Document Nº 1000000036024 V07 Fra
Document nº 1000000036024 v07 FRA Illumina 5200 Illumina Way San Diego, Californie 92122 États-Unis +(1) 800 809-ILMN (4566) +(1) 858 202-4566 (en dehors de l’Amérique du Nord) techsupport@illumina.com www.illumina.com Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques. © 2020 Illumina, Inc. Tous droits réservés.