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Tableau 10x. Résultats du test d'inclusivité pour les souches de Sapovirus.
Cible du
Pathogène
QIAstat-Dx
Sapovirus humain
génogroupe I
Sapovirus humain
génogroupe V
Sapovirus
Sapovirus humain
génogroupe I
Sapovirus humain
génogroupe II
* Souche testée pendant l'étude de vérification de la limite de détection.
Analyse in silico
L'analyse in silico de la réactivité potentielle a montré que les organismes suivants (y compris
les espèces, sous-espèces, sous-types, sérotypes ou sérovars) devraient être détectés avec le
QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 (tableau 11).
Tableau 11. Organismes présentant une réactivité prédite d'après l'analyse in silico.
Cible du QIAstat-Dx GI Panel 2
Bactéries
Campylobacter
Clostridium difficile
Salmonella
Plesiomonas shigelloides
Mode d'emploi du QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 (Manuel) 05/2022
Souche
Fournisseur
QIAGEN
–
Barcelona
Universitat
s.o.
Barcelona
Universitat de
GI.1
Barcelona
Universitat de
GII.3
Barcelona
Organismes présentant une réactivité prévue
(espèces, sous-espèces, sous-types, sérotypes ou sérovars)
Campylobacter coli Campylobacter jejuni, Campylobacter jejuni sous-espèce
jejuni, Campylobacter jejuni sous-espèce Doylei, Campylobacter upsaliensis
Clostridium difficile (y compris les ribotypes 01 et 17 et les souches BI1, BI9,
NAP1, SD1, SD2, M68, M120)
Salmonella bongori, Salmonella enterica sous-espèce salamae II (par ex.
sérovar 55:k:z39), Salmonella enterica sous-espèce arizonae IIIa (par ex.
sérovar 63:g:z51), Salmonella enterica sous-espèce diarizonae IIIb (par ex.
sérovar 47:l,v:z), Salmonella enterica sous-espèce houtenae IV (par ex. sérovar
43:z4), Salmonella enterica sous-espèce indica VI.
Salmonella enterica sous-espèce enterica (jusqu'à 92 sérovars différents y
compris Agona, Anatum, Bareilly, Choleraesuis, Enteritidis, Heidelberg,
Infantis, Kentucky, Montevideo, Newport, Paratyphi A, Senftenberg, Tennessee,
Thompson, Typhi, Typhimurium)
Plesiomonas shigelloides (par ex. souches NCTC10360, ATCC 14029T,
R4605035)
ID catalogue
Fois LoD
Échantillon
1 x LoD
clinique ; GI-88*
Échantillon
clinique ;
1 x LoD
160523351*
Échantillon
clinique ;
1 x LoD
171016324
Échantillon
clinique ;
1 x LoD
215512
91
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