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Les prédictions in silico de réactions croisées potentielles ont montré que les réactions croisées
suivantes peuvent survenir lors du test d'échantillons de selles avec le QIAstat-Dx
Gastrointestinal Panel 2 (tableau 9) (5, 15−17).
Tableau 9. Réactions croisées potentielles basées sur l'analyse in silico
Cible QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2
E. coli entéropathogène (EPEC)
Campylobacter spp.
E. coli productrice de shigatoxines (STEC) stx1
E. coli productrice de shigatoxines (STEC) stx2
E. coli O157
* Notez que ces réactions croisées potentielles affectent les modèles avec des gènes cibles responsables de la
pathogénicité des pathogènes cibles correspondants du QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2, qui peuvent être acquis
au sein d'une espèce dans le cadre d'un processus biologique connu dans les bactéries appelé transfert horizontal
de gène.
Organismes porteurs d'intimine eae rares ou peu courants.
†
Cible sur panel.
‡
Un test in vitro de souches de Campylobacter lari et Campylobacter helveticus à haute concentration a confirmé une
§
réaction croisée potentielle de ces espèces de Campylobacter avec le dosage QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2.
Producteurs de toxines Stx rares ou peu courants.
¶
**E. coli O157 ne sera signalé qu'en cas d'amplification positive pour le modèle E. coli (STEC) conformément à
l'algorithme de signalisation. Un cas rare d'une co-infection à E. coli (STEC) et à E. coliO157 ne se distingue pas
d'une seule infection provoquée par une souche de STEC O157:H7.
Inclusivité (réactivité analytique)
La réactivité analytique (inclusivité) a été évaluée à l'aide d'isolats/souches de pathogènes
gastro-intestinaux sélectionnés en fonction de la pertinence clinique et de la diversité
génétique, temporelle et géographique. D'après les tests in vitro (humides) et de l'analyse in
silico, les amorces et sondes du QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 sont spécifiques et
inclusives pour les souches cliniquement prévalentes et pertinentes pour chaque pathogène
testé.
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Organismes à réaction croisée potentielle
Shigella boydii *
Campylobacter lari
Shigella sonnei *
Acinetobacter haemolyticus*
Enterobacter cloacae*
Escherichia albertii *
Souches d'E.coli O157 non STEC**
Mode d'emploi du QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 (Manuel) 05/2022
, Escherichia albertii *
†‡
†
, Campylobacter helveticus
§
, Shigella dysenteriae*
‡
‡
, Citrobacter freundi*
¶
, Aeromonas caviae*
¶
¶
§
,
¶
¶
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