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Shigella dysenteriae sérotype 1 possède un gène de shigatoxine (stx) identique au gène
stx1 de STEC. Plus récemment, des gènes Stx ont été détectés chez d'autres espèces de
Shigella (p. ex. S. sonnei et S. flexneri). La détection d'analytes Shigella/E. Coli
entéroinvasive (EIEC) et STEC stx1/stx2 dans le même échantillon peut indiquer la
présence d'espèces de Shigella telles que S. dysenteriae. De rares cas de détection de
gènes de shigatoxines dans d'autres genres/espèces ont été rapportés, par exemple
Acinetobacter haemolyticus, Enterobacter cloacae et Citrobacter freundii.
Le résultat pour E. coli O157 n'est rapporté que comme une identification de sérogroupe
spécifique en lien avec le STEC stx1/stx2. Si des souches autres que STEC O157 ont été
détectées dans des selles humaines, leur rôle dans la maladie n'a pas été établi. Le
sérotype O157 EPEC a été identifié et sera détecté par le QIAstat-Dx Gastrointestinal
Panel 2 (par la conception des oligonucléotides d'EPEC) en raison de leur transport du
gène eae.
Le QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 ne peut pas distinguer entre des infections avec un
seul STEC O157 toxicogène ou des co-infections rares de STEC (non-O157) avec E. coli
O157 négatif à stx1/stx2.
Ce test ne détecte que Campylobacter jejuni, C. coli et C. upsaliensis et ne distingue pas
ces trois espèces de Campylobacter. Il faudra effectuer d'autres tests pour différencier
ces espèces et pour détecter d'autres espèces de Campylobacter dans les échantillons de
selles. En particulier, la conception des oligonucléotides de Campylobacter upsaliensis
peut présenter une réactivité croisée avec les organismes C. lari et C. helveticus de
l'espèce Campylobacter.
Un résultat négatif du QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 n'exclut pas la possibilité d'une
infection gastro-intestinale. Des résultats de test négatifs peuvent être obtenus en raison
de variantes de séquences dans la région ciblée par le dosage, de la présence
d'inhibiteurs, d'une erreur technique, d'une confusion entre les échantillons ou une
infection provoquée par un organisme non détecté par le panel. Les résultats de test
peuvent également être affectés par un traitement antimicrobien simultané ou par des
niveaux d'organisme dans l'échantillon inférieurs à la limite de détection du test. Un
diagnostic, une thérapie ou tout autre choix de prise en charge ne doivent en aucun cas
se fonder sur de seuls résultats négatifs.
Mode d'emploi du QIAstat-Dx Gastrointestinal Panel 2 (Manuel) 05/2022
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