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Guide du système NextSeq 550
L002 : images de mise au point de la ligne 2.
L003 : images de mise au point de la ligne 3.
L004 : images de mise au point de la ligne 4.
InterOp : fichiers binaires utilisés par le logiciel Sequencing Analysis Viewer (SAV)..
Logs : fichiers journaux décrivant les étapes de fonctionnement.
Recipe (Formule) : fichier de formule propre à l'analyse portant l'identifiant de la cartouche de réactifs.
RTALogs : fichiers journaux décrivant les étapes de l'analyse.
Thumbnail_Images : vignettes pour les plaques 1, 6 et 12 dans chaque strie de chaque cycle.
RTAComplete.xml
RTAConfiguration.xml
RunInfo.xml
RunNotes.xml
RunParameters.xml
Fichiers de sortie du balayage
T ype de f ichiers
Descriptio n, em placem ent et no m des f ichiers
Fichiers GTC
Fichier de typage génotypique. Un fichier GTC est généré pour chaque échantillon balayé sur la
puce BeadChip. Le nom du fichier comprend le code à barres et l'échantillon balayé.
[code à barres]_[échantillon].gtc
Fichiers images
Les fichiers images sont nommés d'après la zone qui a été balayée sur la puce BeadChip. Ce
nom comprend le code à barres, l'échantillon et la section sur la puce BeadChip, la strie, ainsi
que le canal d'imagerie (rouge ou vert).
[code à barres]_[échantillon]_[section]_[strie]_[caméra]_[plaque]_[canal].jpg
• Code à barres : le nom de fichier commence par le code à barres de la puce BeadChip.
• Échantillon : une zone de la puce BeadChip numérotée selon une rangée (R0X), de haut en
bas, et selon une colonne (C0X), de gauche à droite.
• Section : une rangée numérotée au sein d'un échantillon.
• Strie : les puces BeadChip sont imagées sous la forme d'un ensemble de plaques qui se
chevauchent. Seule une strie est donc utilisée pour l'imagerie de la section.
• Caméra : la caméra utilisée pour recueillir l'image.
• Plaque : une zone d'imagerie qui constitue pour la caméra l'unité de vision.
• Canal : un canal est soit rouge, soit vert.
Document nº 15069765 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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