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Guide du système NextSeq 550
consultez la section
Configurer les options de configuration de l'analyse, à la
Surveiller la progression de l'analyse
1
Surveillez la progression, les intensités et les scores de qualité de l'analyse à mesure que les indicateurs
s'affichent à l'écran.
Figure 19 Progression et indicateurs de l'analyse de séquençage
A Run progress (Progression de l'analyse) : indique l'étape en cours et le nombre de cycles réalisés pour
chaque lecture. La barre de progression n'est pas proportionnelle à la durée d'analyse de chaque
étape. Utilisez le temps restant dans le coin supérieur droit pour déterminer la durée exacte.
B Q-Score (Score de qualité) : indique la répartition des scores de qualité. Consultez la section
la qualité, à la
C Intensity (Intensité) : indique la valeur des intensités dʼamplifiats du 90
Les couleurs du tracé indiquent chaque base : A est rouge, C, vert, G, bleu, et T, noir. Les couleurs
correspondent aux indicateurs de base dans le logiciel Sequencing Analysis Viewer (SAV).
D Cluster Density (K/mm²) (Densité des amplifiats [K/mm²]) : indique le nombre dʼamplifiats détectés pour
lʼanalyse.
E Clusters Passing Filter (%) (Amplifiats passant le filtre [%]) : indique le pourcentage d'amplifiats passant le
filtre. Consultez la section
F Estimated Yield (Gb) (Estimation de rendement [Gb]) : indique le nombre de bases prévues pour
l'analyse.
REMARQUE
Après avoir sélectionné Home (Accueil), il est impossible de revenir en arrière pour afficher les indicateurs de
l'analyse. Toutefois, les indicateurs de l'analyse sont accessibles sur BaseSpace Sequence Hub ou à partir
d'un ordinateur autonome à l'aide du logiciel Sequencing Analysis Viewer (SAV).
Cycles des indicateurs de l'analyse
Les indicateurs de l'analyse apparaissent à différents moments au cours de l'analyse.
Aucun indicateur ne s'affiche au cours des étapes de génération d'amplifiats.
u
Les cinq premiers cycles sont réservés à la génération du modèle.
u
Les indicateurs de l'analyse apparaissent après le cycle 25, notamment la densité des amplifiats,
u
les amplifiats passant par le filtre (PF), le rendement et les scores de qualité.
Document nº 15069765 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
page 64.
Amplifiats passant le filtre, à la
page 13.
e
percentile pour chaque plaque.
page 63.
Notation de
27
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