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Guide du système NextSeq 550
T ype de f ichiers
Descriptio n
Fichier d'index de
Afin de préserver les renseignements d'origine sur les plaques, un fichier d'index de définition
définition des bases
des bases est produit pour chaque ligne. Le fichier d'index contient une paire de valeurs pour
(*.bci)
chaque plaque, qui sont respectivement le numéro de cette plaque et le nombre d'amplifiats
qu'elle contient.
Les fichiers de sortie sont utilisés pour une analyse en aval dans BaseSpace. Vous pouvez aussi utiliser le
logiciel de conversion bcl2fastq pour la conversion FASTQ, ainsi que des solutions d'analyse tierces. Les
fichiers NextSeq nécessitent bcl2fastq v2.0 ou une version ultérieure. Pour obtenir la dernière version de
bcl2fastq, veuillez consulter la
RTA v2 fournit des indicateurs en temps réel sur la qualité de l'analyse, stockés dans des fichiers InterOp.
Les fichiers InterOp sont des fichiers de sortie binaires contenant des indicateurs relatifs aux plaques, aux
cycles et au niveau de lecture nécessaires pour afficher des indicateurs en temps réel en utilisant le logiciel
Sequencing Analysis Viewer (SAV). Pour la dernière version du SAV, consultez la
logiciel SAV
sur le site Web d'Illumina.
Gestion des erreurs
RTA2 crée des fichiers journaux et les enregistre dans le dossier RTALogs. Les erreurs sont enregistrées dans
un fichier d'erreurs au format *.tsv.
Les fichiers journaux et d'erreurs suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du
traitement :
*GlobalLog*.tsv récapitule les événements importants survenus pendant l'analyse.
u
*LaneNLog*.tsv répertorie les événements relatifs au traitement de chaque ligne.
u
*Error*.tsv répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
u
*WarningLog*.tsv répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
u
Flux de travail de Real-Time Analysis
Génération du modèle
Enregistrement et extraction
des intensités
Correction de la mise en
phase
Définition des bases
Notation de la qualité
Document nº 15069765 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
page de téléchargement du système NextSeq
Cartes d'emplacement des amplifiats.
Enregistre l'emplacement de chaque amplifiat sur la Flow Cell et détermine une valeur
d'intensité pour chaque amplifiat.
Corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase.
Détermine une définition des bases pour chaque amplifiat.
Attribue un score de qualité à chaque définition des bases.
sur le site Web d'Illumina.
page de téléchargement du
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