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Guide du système NextSeq 550
Durée de l'analyse de séquençage
La durée de l'analyse de séquençage dépend du nombre de cycles réalisés. La longueur d'analyse
maximale correspond à une analyse à lecture appariée de 150 cycles par lecture (2 x 150), auxquels
s'ajoutent jusqu'à dix cycles pour chacune des deux lectures d'index.
Pour connaître les prévisions de durée et autres spécifications du système, consultez la
spécifications du système NextSeq 550
Nombre de cycles d'une lecture
Au cours d'une analyse de séquençage, une lecture comprend un cycle de plus que le nombre de cycles
analysés. Par exemple, une analyse de 150 cycles à lecture appariée effectue des lectures de 151 cycles
(2 × 151), pour un total de 302 cycles. À la fin de l'analyse, 2 × 150 cycles sont analysés. Le cycle
supplémentaire est requis pour les calculs de mise en phase et en préphase.
Créer une analyse dans Local Run Manager
Le processus de configuration des paramètres de l'analyse de séquençage et de l'analyse des données
dans Local Run Manager varie en fonction du module de flux de travail d'analyse utilisé. Reportez-vous au
guide du module de Local Run Manager pour obtenir les directives sur la façon de créer une analyse.
1
À l'écran d'accueil, sélectionnez Edit Runs (Modifier les analyses).
2
Sélectionnez Create Run (Créer l'analyse) dans le tableau de bord de Local Run Manager,
puis choisissez un module d'analyse.
3
Entrez le nom de l'analyse et les échantillons de l'analyse, et au besoin, importez les fichiers de
manifeste.
4
Enregistrez l'analyse et fermez la fenêtre du tableau de bord de Local Run Manager.
Pour créer une analyse dans le NCS sans l'aide du logiciel Local Run Manager, utilisez le mode d'analyse
manuel. Consultez les sections
page 20.
Créer une analyse avec le NCS
Si vous créez une analyse avec le NCS (mode d'analyse manuel), les paramètres de l'analyse de séquençage
et de l'analyse des données sont saisis immédiatement avant le chargement de la Flow Cell.
1
Revoyez les paramètres requis de l'analyse de séquençage et de l'analyse des données à la section
Saisir les paramètres de l'analyse de séquençage et de l'analyse des données dans le NCS (mode
d'analyse manuel), à la
2
Déterminez immédiatement les paramètres de l'analyse de séquençage et de l'analyse des données
pour éviter tout délai lorsque vous débuterez l'analyse de séquençage.
Préparer la cartouche de réactifs
1
Retirez la cartouche de réactifs de son lieu de stockage entre -25 et -15 °C.
2
Décongelez dans un bain d'eau à température ambiante (environ 60 minutes). N'immergez pas la
cartouche.
3
Tapotez doucement sur la paillasse pour éliminer l'eau de la base, puis séchez la base.
Document nº 15069765 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
sur le site Web d'Illumina.
Créer une analyse avec le NCS, à la page 17
page 22.
page des
et
Modes d'analyse, à la
17
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