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Guide du système NextSeq 550
Le numéro complet de la plaque comporte cinq chiffres pour indiquer son emplacement comme suit :
Surface : 1 représente la surface supérieure, et 2, la surface inférieure
u
Strie : 1, 2 ou 3
u
Caméra : 1, 2, 3, 4, 5 ou 6
u
Plaque : 01, 02, 03, 04, 05, 06, 07, 08, 09, 10, 11 ou 12
u
Exemple : la plaque portant le numéro 12508 indique qu'il s'agit d'une surface supérieure,
de la strie 2, de la caméra 5 et de la plaque 8.
Le numéro complet à cinq chiffres de la plaque est utilisé dans le nom des vignettes et des fichiers de mise en
phase empirique. Pour obtenir plus de renseignements, consultez la section
séquençage, à la
page 65.
Nommage des vignettes
Une vignette pour chaque canal de couleur (rouge et vert) pour les plaques 1, 6 et 12 est générée depuis
toutes les caméras, les surfaces hautes et basses à chaque cycle au cours de l'imagerie. Les fichiers de
vignettes sont générés au format JPG.
Chaque nom d'image commence toujours par s_ et reçoit ensuite les éléments que prévoit la convention de
dénomination suivante :
Ligne : 1, 2, 3 ou 4
u
Plaque : numéro de la plaque à cinq chiffres, correspondant à la surface, à la strie, à la caméra et à la
u
plaque
Canal : rouge ou vert
u
Exemple :
s_3_12512_green.jpg
à la strie 2, à la caméra 5, à la plaque 12 et au canal vert.
Structure des dossiers de sortie de séquençage
Le logiciel de commande génère automatiquement le nom du dossier de sortie.
Data (Données)
Intensities (Intensités)
BaseCalls (Appels de bases)
L001 : fichiers de définition des bases de la ligne 1, rassemblés dans un fichier par cycle.
L002 : fichiers de définition des bases de la ligne 2, rassemblés dans un fichier par cycle.
L003 : fichiers de définition des bases de la ligne 3, rassemblés dans un fichier par cycle.
L004 : fichiers de définition des bases de la ligne 4, rassemblés dans un fichier par cycle.
L001 : fichier *.locs rassemblant les emplacements des amplifiats de la ligne 1.
L002 : fichier *.locs rassemblant les emplacements des amplifiats de la ligne 2.
L003 : fichier *.locs rassemblant les emplacements des amplifiats de la ligne 3.
L004 : fichier *.locs rassemblant les emplacements des amplifiats de la ligne 4.
Images
Focus (Mise au point)
L001 : images de mise au point de la ligne 1.
Document nº 15069765 v07 FRA
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
(s_3_12512_vert.jpg) correspond à la ligne 3, à la surface supérieure,
Fichiers de sortie de
68
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