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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
Fichiers de sortie de séquençage
Type de fichiers
Fichiers de définition des
bases
Fichiers d'emplacement
des amplifiats
Fichiers de filtrage
Fichiers InterOp
Fichier de renseignements
sur l'analyse
Fichiers des miniatures
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Description, emplacement et nom des fichiers
Chaque amplifiat analysé est compris dans un fichier de définition des bases; ces fichiers sont
rassemblés dans un fichier pour chaque cycle, chaque ligne et chaque surface. Le fichier
rassemblé contient la définition des bases ainsi que le score de qualité codé associé à chaque
amplifiat. Les fichiers de définition des bases sont utilisés par BaseSpace Sequence Hub ou
bcl2fastq2.
Data\Intensities\BaseCalls\L001\C1.1
L[ligne]_[surface].cbcl, par exemple L001_1.cbcl
Pour chaque Flow Cell, un fichier d'emplacement des amplifiats binaire comprend les
coordonnées XY des amplifiats sur la plaque. Une disposition hexagonale qui concorde avec
l'emplacement des nanopuits de la Flow Cell prédéfinit les coordonnées.
Data\Intensities
s_[ligne].locs
Le fichier de filtrage spécifie si un amplifiat a franchi les filtres. Les fichiers de filtrage sont
générés au cycle 26 et portent sur 25 cycles de données. Un fichier de filtrage est généré pour
chaque plaque.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
s_[ligne]_[plaque].filter
Les fichiers binaires sont utilisés pour le logiciel Sequencing Analysis Viewer. Les fichiers InterOp
sont mis à jour tout au long de l'analyse.
Dossier
InterOp
Indique le nom de l'analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, si la lecture est une lecture
d'index et le nombre de témoins et de plaques sur la Flow Cell. Le fichier de renseignements sur
l'analyse est créé au début de l'analyse.
[Dossier
racine],
RunInfo.xml
Lorsque ces réglages sont activés, une image miniature est créée après chaque tranche de
10 plaques, pour chaque canal de couleur (rouge et vert).
Thumbnail_Images\L001\C[X.1] : les fichiers sont stockés dans un sous-dossier pour chaque
cycle.
s_[ligne]_[plaque]_[canal].jpg : l'image miniature comprend le numéro de la plaque.
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