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illumina NovaSeq 6000 Guide page 61

Guide du système de séquençage

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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
La génération d'amplifiats prend environ deux heures, puis le séquençage démarre avec le premier cycle.
Les indicateurs sont mis à jour tout au long du séquençage. Les amplifiats passant le filtre, le rendement et
les scores de qualité sont disponibles après le cycle 26. Avant le cycle 26, aucune valeur ne sera affichée
dans les champs. Les champs afficheront la mention « N/A » (S. O.).
État du traitement
L'écran Process Management (Gestion du processus) répertorie l'état de chaque analyse. Dans le menu
principal, cliquez sur Process Management (Gestion du processus).
Pour chaque nom d'analyse, l'écran Process Management (Gestion du processus) répertorie l'état des
processus suivants :
Run Status (État de l'analyse) : en fonction du traitement des fichiers CBCL.
u
Network (Réseau) : en fonction du transfert de fichiers à l'aide de Universal Copy Service.
u
BaseSpace : en fonction du téléversement des fichiers dans BaseSpace Sequence Hub, le cas échéant.
u
Lorsqu'un processus est terminé, un crochet vert s'affiche. Pour plus de renseignements, consultez la
section
Gestion du processus,
Démarrage échelonné d'analyses
Il est possible de configurer et démarrer une analyse sur le côté inactif de l'instrument pendant qu'une
analyse est en cours de l'autre côté. C'est ce que l'on appelle un démarrage échelonné. Les analyses
échelonnées sont configurées pour démarrer à un temps précis pendant l'analyse, tel qu'indiqué par les
états de démarrage suivants du minuteur décroissant.
Run Start: Available (Démarrage de l'analyse : disponible) : le démarrage échelonné est actuellement
u
disponible. La date et l'heure affichées indiquent lorsque le démarrage de l'analyse ne sera plus
disponible. Sélectionnez Sequence (Séquencer) pour commencer une nouvelle analyse échelonnée une
fois que le cycle en cours est terminé.
Run Start: Unavailable (Démarrage de l'analyse : non disponible) : le démarrage échelonné est
u
actuellement indisponible. La date est l'heure affichées indiquent lorsque le démarrage de l'analyse sera
disponible de l'autre côté de l'instrument.
Waiting... (Attente...) : si une nouvelle analyse est lancée alors que le démarrage échelonné n'est pas
u
disponible, l'état change à Waiting (Attente) et la date et l'heure affichées sont une approximation du
moment où l'instrument sera prêt pour une nouvelle analyse. L'instrument procède à la configuration de
l'analyse lorsque que le démarrage échelonné est disponible.
Lorsque vous configurez la nouvelle analyse, le logiciel interrompt et reprend automatiquement l'analyse sur la
Flow Cell adjacente au besoin. Le système est placé en état de sécurité lorsqu'il est interrompu.
Procédure
1
À l'écran Home (Accueil), sélectionnez Sequence (Séquencer), puis A ou B.
Le côté sélectionné doit correspondre au côté inactif.
2
Attendez que l'analyse sur la Flow Cell adjacente s'interrompe. Pour annuler la nouvelle analyse et
prévenir l'interruption, sélectionnez Cancel (Annuler).
Si l'analyse adjacente est à l'étape de la génération d'amplifiats, de la resynthèse des paires de bases,
de l'imagerie ou du lavage, le logiciel termine l'étape en cours avant de s'interrompre.
3
Lorsque l'analyse adjacente s'interrompt et que les portes de la Flow Cell s'ouvrent, configurez la
nouvelle analyse.
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
page 9.
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