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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
Les fichiers journaux suivants sont transférés vers leur emplacement final de sortie à la fin du traitement :
info_00000.log résume les activités d'analyse importantes.
u
error_00000.log répertorie les erreurs survenues au cours d'une analyse.
u
warning_00000.log répertorie les avertissements reçus au cours d'une analyse.
u
Plaques de la Flow Cell
Les plaques sont de petites zones d'imagerie sur la Flow Cell. La caméra prend une image de chaque
témoin, que le logiciel divise en plaques aux fins du traitement par RTA3. Le nombre total de plaques dépend
du nombre de lignes, de témoins et de surfaces qui sont imagés sur la Flow Cell.
Les Flow Cell SP possèdent un total de 312 plaques.
u
Les Flow Cell S1 possèdent un total de 624 plaques.
u
Les Flow Cell S2 possèdent un total de 1 408 plaques.
u
Les Flow Cell S4 possèdent un total de 3 744 plaques.
u
Tableau 14 Plaques de la Flow Cell
Composant de la
SP
Flow Cell
Lignes
2
Surfaces
1
Témoins par
2
ligne
Plaques par
78
témoin
Nombre total de
312
plaques
générées
Numérotation des plaques
Le numéro de la plaque est composé de cinq chiffres qui représentent la position sur la Flow Cell. Par
exemple, le numéro de plaque 1_1205 indique la ligne 1, la surface du haut, le témoin 2 et la plaque 5.
Le premier chiffre représente la ligne :
u
1 ou 2 pour une Flow Cell SP, S1 ou S2.
u
1, 2, 3 ou 4 pour une Flow Cell S4.
u
Le deuxième chiffre représente la surface : 1 pour le haut et 2 pour le bas.
u
Pour la Flow Cell SP, le deuxième chiffre est toujours « 2 » parce que seulement cette Flow Cell a une
surface inférieure.
Le troisième chiffre représente le témoin :
u
1 ou 2 pour une Flow Cell SP ou S1.
u
1, 2, 3 ou 4 pour une Flow Cell S2.
u
1, 2, 3, 4, 5 ou 6 pour une Flow Cell S4.
u
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
S1
S2
S4
Description
2
2
4
Une ligne est un canal physique possédant des ports d'entrée et de
sortie.
2
2
2
Les Flow Cell S1, S2 et S4 sont imagées sur deux surfaces : les
surfaces inférieure et supérieure. La surface supérieure de la plaque
est imagée en premier. La Flow Cell SP est imagée sur la surface
inférieure uniquement.
2
4
6
Un témoin est une colonne d'une ligne de la Flow Cell que la
camera saisie dans une seule image.
78
88
78
Une plaque est une partie d'un témoin qui montre une zone imagée
sur la Flow Cell.
624
1 408
3 744
Lignes × surfaces × témoins × plaques par témoins = nombre total
de plaques.
67
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