Publicité
Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
REMARQUE
Le nombre de cycles analysés dans la lecture 1 et la lecture 2 est égal à la valeur saisie moins un cycle. Par
exemple, pour une analyse de 150 cycles à lecture appariée (analyse 2 × 150 pb), entrez 151 pour la
lecture 1 et la lecture 2.
Pour les trousses v1.0, la somme des quatre valeurs saisies peut dépasser le nombre de cycles indiqués
pour les trousses de réactifs sélectionnées, jusqu'à 23 cycles de plus pour les analyses à lecture appariée et
30 cycles de plus pour les analyses à lecture unique.
Pour les trousses v1.5, la somme des quatre valeurs saisies peut dépasser le nombre de cycles indiqués
pour les trousses de réactifs sélectionnées, jusqu'à 38 cycles de plus pour les analyses à lecture appariée et
à lecture unique.
La trousse S4 de 35 cycles contient un total de 72 cycles de séquençage. La somme des quatre valeurs
peut dépasser le nombre indiqué par un maximum de 37 cycles de plus. Les valeurs de lecture par défaut
peuvent être modifiées et le nombre de cycles peut être distribué à travers les quatre lectures, par exemple :
36, 10, 10 et 0.
4
Déroulez Advanced Settings (Paramètres avancés) pour appliquer les paramètres à l'analyse en cours.
Ces paramètres sont facultatifs, sauf indication contraire.
v1.0 Custom Primers (Primers personnalisés v1.0) : sélectionnez la case Custom Primers (Primers
u
personnalisés), puis sélectionnez les cases appropriées. Illumina DNA PCR-Free Prep,
Tagmentation : le primer de séquençage Read 1 (Lecture 1) (VP10) personnalisé est nécessaire pour
les librairies si vous utilisez les trousses v1.0. Consultez le Guide des primers personnalisés de la série
NovaSeq (document nº 1000000022266) pour plus de renseignements.
Read 1 (Lecture 1) : utilisez le primer personnalisé pour la lecture 1.
u
Read 2 (Lecture 2) : utilisez le primer personnalisé pour la lecture 2.
u
Custom Index (Index personnalisé) : utilisez le primer personnalisé pour l'index 1.
u
v1.5 Custom Primers (Primers personnalisés v1.5) : sélectionnez la case Custom Primers (Primers
u
personnalisés), puis sélectionnez les cases appropriées. Illumina DNA PCR-Free Prep,
Tagmentation : aucun primer personnalisé n'est nécessaire pour les librairies si vous utilisez les
trousses v1.5. Consultez le Guide des primers personnalisés de la série NovaSeq (document
nº 1000000022266) pour plus de renseignements.
Read 1 (Lecture 1) : utilisez le primer personnalisé pour la lecture 1.
u
Read 2 (Lecture 2) : utilisez le primer personnalisé pour la lecture 2.
u
Custom Index (Index personnalisé) : utilisez le primer personnalisé pour les lectures d'index 1 et
u
d'index 2.
Fichier de sortie : sélectionnez Browse (Naviguer) pour changer le fichier de sortie pour l'analyse en
u
cours. Un dossier de sortie est requis lorsque l'analyse n'est pas connectée à
BaseSpace Sequence Hub pour le stockage.
Samplesheet (Feuille d'échantillons) : sélectionnez Browse (Naviguer) pour téléverser la feuille
u
d'échantillons, qui est requise lorsque BaseSpace Sequence Hub est utilisé pour la surveillance de
l'analyse et le stockage, ou un autre fichier CSV. Le fichier CVS est copié dans le dossier de sortie et
n'a pas d'incidence sur les paramètres de l'analyse. Assurez-vous que la feuille d'échantillons est au
format approprié (direction d'adaptateur de la lecture d'index 2) en fonction des flux de travail v1.0 et
v1.5, qui utilisent différentes stratégies. Le flux de travail du brin direct est exécuté avec les trousses
de réactifs v1.0. Le flux de travail du complément inverse est exécuté avec les trousses de réactifs
v1.5.
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
49
Publicité
