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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
Les deux derniers chiffres représentent le numéro de plaque. La numérotation des plaques commence
u
à 01 à l'extrémité de sortie de la Flow Cell et va jusqu'à 88 ou 78 à l'extrémité d'entrée.
01 à 78 pour une Flow Cell SP, S1 ou S4.
u
01 à 88 pour une Flow Cell S2.
u
Flux de travail de Real-Time Analysis
Enregistrement
Extraction des intensités
Correction de la mise en
phase
Définition des bases
Notation de la qualité
Enregistrement
La fonction d'enregistrement aligne une image au réseau hexagonal de nanopuits sur la Flow Cell structurée.
En raison de l'arrangement ordonné des nanopuits, les coordonnées X et Y sont prédéterminées pour
chaque amplifiat dans une plaque. Les positions des amplifiats de chaque analyse s'inscrivent dans un
même fichier d'emplacement des amplifiats (s.locs).
S'il y a échec d'enregistrement de l'image d'un cycle, quelle qu'elle soit, aucune définition des bases ne sera
générée pour cette plaque dans ce cycle. Utilisez le logiciel Sequencing Analysis Viewer pour trouver les
images n'ayant pas été enregistrées.
Extraction des intensités
Après l'enregistrement, la fonction d'extraction des intensités calcule une valeur d'intensité pour chaque
nanopuits dans une image donnée. Si l'enregistrement échoue, l'intensité de la plaque ne peut pas être
extraite.
Correction de la mise en phase
Lors de la réaction de séquençage, chaque brin d'ADN dans un amplifiat s'étend d'une base par cycle.
La mise en phase et la mise en préphase ont lieu lorsqu'un brin est déphasé par rapport au cycle
d'incorporation en cours.
La mise en phase se produit lorsqu'un brin a un retard d'une base.
u
La mise en préphase se produit lorsqu'un brin a une avance d'une base.
u
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Enregistre l'emplacement de chaque amplifiat sur la Flow Cell structurée.
Détermine une valeur d'intensité pour chaque amplifiat.
Corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase.
Détermine une définition des bases pour chaque amplifiat.
Attribue un score de qualité à chaque définition des bases.
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