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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
Nécessite la connexion de l'instrument à un réseau ayant accès à Internet.
u
Est activé par défaut. Pour choisir de ne pas utiliser ce service, désactivez le paramètre Send
u
Instrument Performance Data to Illumina (Envoyer les données sur la performance de l'instrument à
Illumina).
Lorsqu'elle est activée, cette option requiert une connexion Internet externe.
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Sélectionnez Save (Enregistrer).
Configuration des sorties LIMS
Si votre système est configuré pour utiliser le mode fondé sur les fichiers et que vous utilisez un autre
logiciel LIMS que BaseSpace Clarity LIMS, configurez le LIMS de façon à ce que le fichier de configuration de
l'analyse soit généré au format *.json. Pour le flux de travail standard, le nom de fichier doit correspondre à
l'identifiant du tube de librairies. Le champ d'identifiant de la Flow Cell peut être laissé vide. Pour le flux de
travail NovaSeq Xp, le nom de fichier doit correspondre à l'identifiant de la Flow Cell et l'identifiant de la
Flow Cell ainsi que de la librairies doivent être spécifiés dans le fichier. Le nom de fichier et les valeurs ne sont
pas sensibles à la casse.
Le logiciel LIMS externe peut utiliser l'interface de programmation d'applications (API) LIMS NovaSeq pour
interagir avec le NovaSeq 6000. Communiquez avec l'assistance technique d'Illumina pour plus de
renseignements sur les points d'extrémité de l'API.
Nom du champ
run_name
run_mode
workflow_type
librarytube_ID
rehyb*
sample_loading_type
Flowcell_ID
paired_end
read1
read2
index_read1
index_read2
output_folder
sample-sheet
use_basespace
basespace_mode
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Valeurs
Nom choisi pour l'analyse, qui peut comprendre des caractères
alphanumériques, des tirets et du soulignement
L'un des modes suivants :
• SP
• S1
• S2
• S4
NoIndex (Aucun index), SingleIndex (Un seul index), ou DualIndex (Deux index)
Identifiant RFID du tube de librairies
True (Vrai) ou False (Faux)
NovaSeqStandard ou NovaSeqXp
L'identifiant de la Flow Cell
True (Vrai) ou False (Faux)
Une valeur allant jusqu'à 251 (jusuq'à 259 cycles de lectures IMU
supplémentaires possibles)
Une valeur allant jusqu'à 251 (jusuq'à 259 cycles de lectures IMU
supplémentaires possibles)
N'importe quelle valeur
N'importe quelle valeur
Chemin vers le dossier de sortie comportant deux barres obliques inverses pour
les séquences d'échappement
Chemin vers une feuille d'échantillons ou un autre fichier *.csv comportant deux
barres obliques inverses pour les séquences d'échappement
True (Vrai) ou False (Faux)
RunMonitoringOnly (Surveillance de l'analyse uniquement) ou
RunMonitoringAndStorage (Surveillance de l'analyse et stockage)
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