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illumina NovaSeq 6000 Guide page 32

Guide du système de séquençage

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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
Nom du champ
use_custom_read1_primer
use_custom_read2_primer
use_custom_index_read1_primer
use_custom_index_read2_primer
* La réhybridation n'est pas disponible avec NVCS v1.4.0 ou une version antérieure.
Exemple : un fichier *.json nommé H6655DMXX.json :
{
"run_name": "2x151_PhiX",
"run_mode": "S2",
"workflow_type": "NoIndex",
"sample_loading_type": "NovaSeqXp",
"librarytube_ID": "NV1236655-LIB", "flowcell_ID": "H6655DMXX",
"rehyb": false,
"paired_end": true,
"read1": 151,
"read2": 151,
"index_read1": 0,
"index_read2": 0,
"output_folder": "\\\\sgnt-prd-isi01\\NovaSEQ\\SeqRuns",
"attachment": "\\\\sgnt-prd-isi01\\NVSQ\\SampleSheet.csv",
"use_basespace": false,
"basespace_mode": null,
"use_custom_read1_primer": false,
"use_custom_read2_primer": false,
"use_custom_index_read1_primer": false
}
Configurer les cycles d'index par défaut
Vous pouvez configurer le nombre par défaut des cycles d'index pour le flux de travail standard comme suit.
1
Dans le menu principal, cliquez sur Settings (Paramètres).
L'écran des paramètres s'ouvre à l'onglet Mode Selection (Sélection du mode).
2
Cliquez sur l'onglet Workflow Selection (Sélection du flux de travail).
3
Entrez le nombre par défaut des cycles d'index dans la boîte de texte Index Cycles (Cycles d'index).
4
Sélectionnez Save (Enregistrer).
Flux de travail NovaSeq standard et NovaSeq Xp
Les flux de travail NovaSeq standard et NovaSeq Xp utilisent tous deux la chimie ExAmp exclusive à Illumina.
Flux de travail standard
u
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Valeurs
True (Vrai) ou False (Faux)
True (Vrai) ou False (Faux)
True (Vrai) ou False (Faux)
True (Vrai) ou False (Faux)
23

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