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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
1
[Facultatif]
Effectuez la mise à jour des paramètres de BaseSpace Sequence Hub pour l'analyse en
cours :
Pour désactiver BaseSpace Sequence Hub, désactivez la case BaseSpace Sequence Hub, puis
u
sélectionnez Run Setup (Configuration de l'analyse) pour continuer sans ouvrir de session.
Pour envoyer les données d'analyse à BaseSpace Sequence Hub en vue de la surveillance à
u
distance ou de l'analyse des données, sélectionnez Run Monitoring and Storage (Surveillance de
l'analyse et stockage). Cette option requiert une feuille d'échantillons.
Pour envoyer des fichiers InterOp, runinfo.xml et runParameters.xml à BaseSpace Sequence Hub en
u
vue de surveiller l'analyse à distance, sélectionnez Run Monitoring Only (Surveillance de l'analyse
uniquement).
2
Saisissez votre nom d'utilisateur et votre mot de passe BaseSpace Sequence Hub, puis sélectionnez
Sign In (Ouverture de session).
3
Si vous y êtes invité, sélectionnez un groupe de travail pour le téléversement des données d'analyse, puis
sélectionnez Run Setup (Configuration de l'analyse).
Vous y serez invité seulement si vous faites partie de plusieurs groupes de travail.
Saisir les paramètres de l'analyse
1
Si le flux de travail NovaSeq Xp est activé, sélectionnez un type de flux de travail.
Si vous sélectionnez NovaSeq Xp, assurez-vous qu'un tube de librairies vide est chargé.
u
Si vous sélectionnez NovaSeq Standard, assurez-vous que l'échantillon est chargé dans le tube de
u
librairies.
2
Dans le champ Run Name (Nom de l'analyse), entrez le nom de votre choix pour l'analyse en cours.
Le nom de l'analyse peut contenir des caractères alphanumériques, des tirets et des traits de
soulignement.
3
Indiquez le nombre de cycles pour chaque longueur de lecture et d'index de l'analyse de séquençage.
Il n'y a pas de nombre maximum de cycles d'index. Toutefois, la somme des lectures d'index et des
cycles d'index ne doit pas dépasser le nombre de cycles pour la trousse.
Read 1 (Lecture 1) : saisissez une valeur dans la limite de 151 cycles pour les trousses v1.0 de
u
300 cycles, ou dans la limite de 251 cycles pour les trousses v1.0 de 500 cycles. Saisissez une valeur
dans la limite de 159 cycles pour les trousses v1.5 de 300 cycles, ou dans la limite de 259 pour les
trousses v1.5 de 500 cycles.
Index 1 : saisissez le nombre de cycles pour le primer d'index 1 (i7).
u
Index 2 : saisissez le nombre de cycles pour le primer d'index 2 (i5).
u
Read 2 (Lecture 2) : saisissez une valeur dans la limite de 151 cycles pour les trousses v1.0 de
u
300 cycles, ou dans la limite de 251 cycles pour les trousses v1.0 de 500 cycles. Saisissez une valeur
dans la limite de 159 cycles pour les trousses v1.5 de 300 cycles, ou dans la limite de 259 pour les
trousses v1.5 de 500 cycles. Cette valeur est généralement la même que la valeur de la lecture 1.
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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