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Guide du système de séquençage NovaSeq 6000
Figure 31 Mise en phase et en préphase
A Lecture avec une base présentant une mise en phase
B Lecture avec une base présentant une mise en préphase
RTA3 corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase, ce qui maximise la qualité des
données à chaque cycle tout au long de l'analyse.
Définition des bases
La définition des bases détermine une base (A, C, G ou T) pour chaque amplifiat d'une plaque donnée d'un
cycle spécifique. Le système de séquençage NovaSeq 6000 utilise un séquençage à deux canaux, qui ne
nécessite que deux images pour encoder les données de quatre bases d'ADN, une provenant du canal
rouge et une autre du canal vert.
L'absence de définition est indiquée par la lettre N. Il n'y a aucune définition lorsqu'un amplifiat ne passe pas
le filtre, que l'enregistrement échoue ou que l'amplifiat se trouve hors de l'image.
Les intensités de chaque amplifiat sont extraites de l'image rouge et de l'image verte, puis sont comparées
l'une à l'autre, ce qui donne quatre populations distinctes. Chaque population correspond à une base.
Le processus de définition des bases détermine à quelle population appartient chaque amplifiat.
Figure 32 Visualisation de l'intensité des amplifiats
Tableau 15 Définition des bases dans le séquençage à deux canaux
Base
Canal rouge
A
1 (allumé)
C
1 (allumé)
G
0 (éteint)
T
0 (éteint)
Document nº 1000000019358 v14 FRA Support nº 20023471
Destiné à la recherche uniquement.
Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Canal vert
Résultat
1 (allumé)
Amplifiats montrant une intensité tant dans le canal rouge que dans le canal vert.
0 (éteint)
Amplifiats montrant une intensité seulement dans le canal rouge.
0 (éteint)
Amplifiats ne montrant d'intensité dans aucun emplacement d'amplifiat connu.
1 (allumé)
Amplifiats montrant une intensité seulement dans le canal vert.
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