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Guide du système HiSeq 2000
Type de fichier
Fichier de renseignements
sur l'analyse
Fichiers des miniatures
Structure du dossier de sortie
Config : paramètres de configuration de l'analyse.
Data
Intensities
BaseCalls
L00[X] : fichiers de définition des bases de chaque ligne, rassemblés dans un fichier par cycle.
Phasing : fichiers de mise en phase empirique, un fichier par plaque à chaque cycle.
L00[X] : fichiers d'emplacements cumulés des amplifiats pour chaque ligne.
Offsets :deux fichiers contenant les décalages de l'analyse.
RTAConfiguration.xml
Images
Focus
L00[X] : images de mise au point pour chaque ligne.
InterOp : fichiers binaires utilisés par le logiciel Sequencing Analysis Viewer.
Logs : fichiers journaux décrivant les événements de fonctionnement.
Recipe : fichier de formule propre à l'analyse portant l'identifiant de la cartouche de réactifs.
RTALogs : fichiers journaux décrivant les événements de RTA.
Thumbnail_Images : images miniatures des neuf emplacements de chaque plaque, générées pour
chaque cycle et pour chaque base.
RunInfo.xml
RunParameters.xml
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Description, emplacement et nom des fichiers
Indique le nom de l'analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, si la lecture est une lecture
indexée et le nombre de témoins et de plaques sur la Flow Cell. Le fichier de renseignements sur
l'analyse est créé au début de l'analyse.
[Dossier racine]
RunInfo.xml
Image miniature pour chaque canal et plaque dans chaque témoin à chaque cycle pendant
l'imagerie.
Thumbnail_Images\L00[X]\C[X.1] : les fichiers sont stockés dans un dossier pour chaque ligne et
dans un sous-dossier pour chaque cycle.
s_[ligne]_[plaque]_[canal].jpg : la plaque est représentée par un nombre à quatre chiffres qui
indique la surface, le témoin et la plaque. Consultez la section
page 71.
Numérotation des plaques,
70
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