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Guide du système HiSeq 2000
Saisir les paramètres de l'analyse
Commencez la configuration de l'analyse en saisissant les paramètres de l'analyse dans une série d'écrans
sous l'onglet Run Configuration (Configuration de l'analyse). Le logiciel vous guidera à travers les écrans afin
de définir la connectivité BaseSpace Sequence Hub, de saisir les identifiants des consommables, de
sélectionner les options d'indexage et de consigner d'autres paramètres.
Écran Integration (Intégration)
L'écran Integration (Intégration) permet de connecter l'analyse à BaseSpace Sequence Hub.
1
À l'écran de bienvenue, sélectionnez Sequence | New Run (Séquence | Nouvelle analyse) pour afficher
l'écran Integration (Intégration).
2
[Facultatif]
Établissez la connexion à BaseSpace Sequence Hub de la façon suivante.
a
Sélectionnez BaseSpace.
b Sélectionnez l'une des options BaseSpace suivantes :
Storage and Analysis (Stockage et analyse) : envoi des données de l'analyse à
u
BaseSpace Sequence Hub pour la surveillance à distance et l'analyse des données. Cette option
requiert une feuille d'échantillons.
Run Monitoring Only (Surveillance de l'analyse uniquement) : envoi des fichiers InterOp à
u
BaseSpace Sequence Hub uniquement, ce qui permet de surveiller l'analyse à distance.
c
Connectez-vous à BaseSpace Sequence Hub à l'aide de l'adresse électronique et du mot de passe
de votre compte MyIllumina.
3
[Facultatif]
Pour procéder sans vous connecter à BaseSpace Sequence Hub, sélectionnez None (Aucun).
4
Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Storage (Stockage)
1
Cochez la case Save to an output folder (Enregistrer dans un dossier de sortie), puis sélectionnez
Browse (Parcourir) pour accéder à l'emplacement réseau de votre choix.
Si l'analyse est connectée à BaseSpace Sequence Hub pour le stockage et l'analyse, cette étape
est facultative.
2
Sélectionnez Zip BCL files (Compresser les fichiers BCL) pour réduire l'espace de stockage requis.
Si l'analyse est connectée à BaseSpace Sequence Hub, l'option Zip BCL files (Compresser les fichiers
BCL) est sélectionnée par défaut.
REMARQUE
Le paramètre Bin Q-Scores (Éliminer les scores de qualité) est activé par défaut afin de réduire l'espace
de stockage requis. Ce paramètre regroupe les scores de qualité sur une plage de valeurs plus étendue
sans nuire à la précision ou aux performances.
3
Sélectionnez l'une des options Save Auxiliary Files (Enregistrer les fichiers auxiliaires) suivantes :
Save All Thumbnails (Enregistrer toutes les miniatures) : enregistre toutes les images miniatures.
u
Une miniature est un échantillon d'images en provenance de nombreuses plaques dans chaque
colonne de plaques, ou témoin, combinées en une seule image miniature.
Save Tile Thumbnails (Enregistrer les miniatures de plaques) : enregistre les images miniatures des
u
plaques. Les miniatures de plaques représentent une seule plaque au lieu d'un échantillon de
plaques dans un témoin.
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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