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Guide du système HiSeq 2000
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Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Flow Cell Setup (Configuration de la Flow Cell)
L'écran Flow Cell Setup (Configuration de la Flow Cell) consigne des renseignements sur la Flow Cell utilisée
pour l'analyse. Tous les champs sont requis.
1
Numérisez ou saisissez l'identifiant (numéro du code à barres) de la Flow Cell à séquencer.
L'identifiant de la Flow Cell sert à déterminer le type de Flow Cell et la compatibilité des réactifs.
2
Assurez-vous que le type de Flow Cell est HiSeq Flow Cell v4.
3
Saisissez un nom d'expérience qui apparaîtra sur chaque écran et permettra l'identification de l'analyse
en cours.
4
Saisissez un nom d'utilisateur, puis sélectionnez Next (Suivant).
Écran Advanced (Paramètres avancés)
1
[Facultatif]
Cochez la case Confirm First Base (Confirmer la première base).
Un rapport de la première base est automatiquement généré pour chaque analyse. Si vous cochez cette
option, le rapport de la première base s'ouvrira avant que l'analyse puisse se poursuivre.
2
[Facultatif]
Décochez la case Align to PhiX (Aligner sur PhiX) pour chaque ligne ne contenant pas le
contrôle PhiX.
Vous pouvez également sélectionner les lignes de l'image de la Flow Cell pour ajouter ou supprimer des
lignes en vue d'un alignement PhiX.
Par défaut, toutes les lignes sont cochées pour que l'alignement soit fait.
REMARQUE
Avec les logiciels HCS v2.2 et RTA v1.18, vous n'avez pas besoin d'une ligne de contrôle dédiée; elle est
facultative.
3
Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Recipe (Formule)
1
Choisissez parmi les options de type d'index suivantes :
No Index (Sans index) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée sans index.
u
Single Index (Index simple) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée avec une
u
seule lecture d'indexage.
Dual Index (Index double) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée avec deux
u
lectures d'indexage.
Custom (Personnalisé) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée avec un nombre
u
personnalisé de cycles pour les lectures d'index.
2
Si l'option Dual Index (Index double) ou l'option Custom (Personnalisé) est choisie, sélectionnez un format
de Flow Cell, soit Single Read (À lecture unique) ou Paired End (Appariée).
3
Entrez le nombre de cycles pour la lecture 1 et la lecture 2, s'il y a lieu.
Chaque lecture comprend un cycle de plus que le nombre de cycles analysés. Par exemple, pour
effectuer 125 cycles pour la lecture 1, entrez 126.
4
Pour l'option d'indexage Custom (Personnalisé), saisissez le nombre de cycles pour les lectures d'index.
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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