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Guide du système HiSeq 2000
1
À l'écran de bienvenue, sélectionnez Sequence | New Run (Séquence | Nouvelle analyse) pour afficher
l'écran Integration (Intégration).
2
[Facultatif]
Établissez la connexion à BaseSpace Sequence Hub de la façon suivante.
a
Sélectionnez BaseSpace.
b Sélectionnez l'une des options BaseSpace suivantes :
Storage and Analysis (Stockage et analyse) : envoi des données de l'analyse à
u
BaseSpace Sequence Hub pour la surveillance à distance et l'analyse des données. Cette option
requiert une feuille d'échantillons.
Run Monitoring Only (Surveillance de l'analyse uniquement) : envoi des fichiers InterOp à
u
BaseSpace Sequence Hub uniquement, ce qui permet de surveiller l'analyse à distance.
c
Connectez-vous à BaseSpace Sequence Hub à l'aide de l'adresse électronique et du mot de passe
de votre compte MyIllumina.
3
[Facultatif]
Pour procéder sans vous connecter à BaseSpace Sequence Hub, sélectionnez None (Aucun).
4
Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Storage (Stockage)
1
Cochez la case Save to an output folder (Enregistrer dans un dossier de sortie), puis sélectionnez
Browse (Parcourir) pour accéder à l'emplacement réseau de votre choix.
Si l'analyse est connectée à BaseSpace Sequence Hub pour le stockage et l'analyse, cette étape
est facultative.
2
Sélectionnez Zip BCL files (Compresser les fichiers BCL) pour réduire l'espace de stockage requis.
Si l'analyse est connectée à BaseSpace Sequence Hub, l'option Zip BCL files (Compresser les fichiers
BCL) est sélectionnée par défaut.
REMARQUE
Le paramètre Bin Q-Scores (Éliminer les scores de qualité) est activé par défaut afin de réduire l'espace
de stockage requis. Ce paramètre regroupe les scores de qualité sur une plage de valeurs plus étendue
sans nuire à la précision ou aux performances.
3
Sélectionnez l'une des options Save Auxiliary Files (Enregistrer les fichiers auxiliaires) suivantes :
Save All Thumbnails (Enregistrer toutes les miniatures) : enregistre toutes les images miniatures.
u
Une miniature est un échantillon d'images en provenance de nombreuses plaques dans chaque
colonne de plaques, ou témoin, combinées en une seule image miniature.
Save Tile Thumbnails (Enregistrer les miniatures de plaques) : enregistre les images miniatures des
u
plaques. Les miniatures de plaques représentent une seule plaque au lieu d'un échantillon de
plaques dans un témoin.
4
Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Flow Cell Setup (Configuration de la Flow Cell)
L'écran Flow Cell Setup (Configuration de la Flow Cell) consigne des renseignements sur la Flow Cell utilisée
pour l'analyse.
1
Numérisez ou saisissez l'identifiant (numéro du code à barres) de la Flow Cell à séquencer.
L'identifiant de la Flow Cell sert à déterminer le type de Flow Cell et la compatibilité des réactifs.
2
Confirmez que le type de Flow Cell est HiSeq Flow Cell v3.
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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