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Chapitre 3 Séquençage en mode HiSeq v4
Introduction
Flux de travail de séquençage HiSeq v4
Préparer les réactifs
Saisir les paramètres de l'analyse
Charger et amorcer les réactifs
Charger la Flow Cell de séquençage
Surveiller l'analyse
Décharger les réactifs
Réaliser un lavage à l'eau
Introduction
Pour effectuer une analyse de séquençage en mode HiSeq v4 sur l'instrument HiSeq 2000, préparez tous les
réactifs, puis suivez les invites du logiciel pour configurer l'analyse. Les étapes de configuration de l'analyse
consistent à entrer les paramètres de l'analyse, à charger et amorcer les réactifs, à charger la Flow Cell et à
procéder à une vérification du système fluidique.
Pour obtenir des renseignements sur la durée des analyses ainsi que sur d'autres caractéristiques de
performance, consultez la page relative aux caractéristiques de l'instrument HiSeq 2000 sur le site Web
d'Illumina.
Échelonner des analyses
Vous pouvez démarrer une nouvelle analyse sur la Flow Cell A ou sur la Flow Cell B lorsqu'une analyse est en
cours sur la Flow Cell adjacente. Pour de plus amples renseignements, consultez la section
analyses sur la Flow Cell A et la Flow Cell B,
Types d'analyse pour la chimie HiSeq v4
Le tableau suivant indique les types d'analyse de séquençage et le nombre de cycles possibles pour chaque
lecture lorsque vous utilisez la chimie HiSeq v4. Utilisez ces renseignements lors de la configuration de
l'analyse.
Type d'analyse
Lecture unique,
sans index
Lecture unique,
index simple
Lecture unique,
index double
Lecture appariée,
sans index
Lecture appariée,
index simple
Lecture appariée,
Index double
¹ Nombre de cycles pour les librairies à index simple
² Nombre de cycles pour les librairies à index double
³ La lecture de l'index 2 d'une analyse appariée à index double comprend sept cycles supplémentaires uniquement chimiques
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
page 60.
Cycles de la
Cycles de lecture
lecture 1
de l'index 1 (i7)
≤ 126
--
≤ 126
6 ou 7 ¹
8 ²
≤ 126
8
≤ 126
--
≤ 126
7 ¹
8 ²
≤ 126
8
Cycles de lecture
Cycles de la
de l'index 2 (i5)
lecture 2
--
--
--
--
8
--
--
≤ 126
--
≤ 126
7 + 8 ³
≤ 126
12
13
13
16
19
24
27
28
28
Échelonner les
Nombre total
de cycles
≤ 126
≤ 133 ¹
≤ 134 ²
≤ 142
≤ 252
≤ 259 ¹
≤ 260 ²
≤ 275
12
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