Publicité
Guide du système HiSeq 2000
Le score de qualité est un moyen simple d'indiquer la probabilité de petites erreurs. Q(X) représente les
scores de qualité, où X est le score. Le tableau suivant montre la relation entre le score de qualité et la
probabilité d'une erreur.
Score de qualité Q(X)
Q40
Q30
Q20
Q10
REMARQUE
La notation de la qualité s'appuie sur une version modifiée de l'algorithme Phred.
La notation de la qualité calcule un ensemble d'indicateurs prévisionnels pour chaque définition des bases,
puis utilise ces valeurs pour rechercher un score de qualité dans un tableau de qualité. Les tableaux de
qualité servent à fournir des indicateurs de qualité extrêmement précis pour des analyses générées par une
configuration spécifique de plateforme de séquençage et de version de chimie.
Une fois le score de qualité établi, les résultats sont enregistrés dans les fichiers de définition des bases.
Compartimentage par score de qualité
Le logiciel RTA regroupe les scores de qualité selon des plages ou compartiments spécifiques et attribue une
valeur à chaque plage. Le compartimentage par score de qualité réduit considérablement les besoins en
espace de stockage, sans affecter la précision ou le fonctionnement des applications en aval.
Le compartimentage par score de qualité contribue à l'efficacité du traitement des analyses et du transfert
de données associés au débit élevé du système HiSeq 2000. Le fichier *.bcl qui en résulte est plus petit en
raison des algorithmes de compression, qui parviennent à mieux compresser le fichier. La quantité de
données écrites sur l'ordinateur de l'instrument est réduite. Les données sont transférées à un emplacement
réseau, ce qui permet de copier le fichier plus vite.
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Probabilité d'une erreur
0,0001 (1 sur 10 000)
0,001 (1 sur 1 000)
0,01 (1 sur 100)
0,1 (1 sur 10)
67
Publicité
