Publicité
Guide du système HiSeq 2000
Surveiller les indicateurs de l'analyse
Le logiciel RTA génère automatiquement des indicateurs de qualité lorsque l'analyse des images commence.
Les indicateurs ne sont toutefois pas tous disponibles aux premiers cycles, car certains processus
nécessitent plusieurs cycles pour générer des données.
Données
Analyse des images
Définition des bases
Estimations de mise en
phase
Scores de qualité
Taux d'erreur
Contrôles en ligne
Nombre d'index
* Le visualiseur d'analyse de séquençage (SAV) v1.8.44 et ses versions ultérieures ne comportent plus l'onglet TruSeq Controls (Commandes
TruSeq), où SAV indiquait les résultats de l'analyse des contrôles en ligne.
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
Cycle
Après le cycle 5.
Pendant les cinq premiers cycles de l'analyse, le logiciel RTA génère un modèle
d'emplacements des amplifiats.
Après le cycle 12.
La définition des bases commence une fois la matrice de couleurs établie, au cycle 12.
Après le cycle 25.
Les corrections de mise en phase pour les 25 premiers cycles déterminent l'estimation de
mise en phase.
Après le cycle 25.
Un score de qualité est généré pour les lectures qui réussissent le filtrage de qualité.
Puisque les scores de qualité nécessitent les intensités corrigées de futurs cycles,
l'évaluation de la qualité vient toujours après la définition des bases.
Après le cycle 25.
Les taux d'erreurs ne seront générés qu'en présence d'amplifiats PhiX, si vous avez
sélectionné l'option Align to PhiX (Aligner sur PhiX) au moment de configurer l'analyse.
Au cycle 52 de chaque lecture ou à la fin de l'analyse pour les analyses de moins de
52 cycles.
Les contrôles en ligne sont générés uniquement pour les méthodes de préparation de
librairies TruSeq.*
Une fois les lectures d'index terminées.
Le nombre d'index par ligne est généré uniquement lorsqu'une feuille d'échantillons est
fournie.
68
Publicité
