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Chapitre 4 Séquençage en mode TruSeq v3
Introduction
Flux de travail de séquençage TruSeq v3
Préparer les réactifs pour la lecture 1
Saisir les paramètres de l'analyse
Charger et amorcer les réactifs
Charger la Flow Cell de séquençage
Surveiller l'analyse
Préparer les réactifs pour la lecture 2
Décharger les réactifs
Réaliser un lavage à l'eau
Introduction
Pour réaliser une analyse de séquençage en mode TruSeq v3 sur l'instrument HiSeq 2000, préparez les
réactifs SBS pour la lecture 1 et les réactifs d'indexage avant de configurer l'analyse. Suivez les invites du
logiciel pour configurer l'analyse. Les étapes de configuration de l'analyse consistent à entrer les paramètres
de l'analyse, à charger et amorcer les réactifs, à charger la Flow Cell et à procéder à une vérification du
système fluidique. Après la lecture 1 et les lectures d'index, préparez et chargez les réactifs appariés et les
réactifs SBS pour la lecture 2.
Pour obtenir des renseignements sur la durée des analyses ainsi que sur d'autres caractéristiques de
performance, consultez la page relative aux caractéristiques de l'instrument HiSeq 2000 sur le site Web
d'Illumina.
Échelonner des analyses
Vous pouvez démarrer une nouvelle analyse sur la Flow Cell A ou sur la Flow Cell B lorsqu'une analyse est en
cours sur la Flow Cell adjacente. Pour de plus amples renseignements, consultez la section
analyses sur la Flow Cell A et la Flow Cell B,
Types d'analyse pour la chimie TruSeq v3
Le tableau suivant indique les types d'analyse de séquençage et le nombre de cycles possibles pour chaque
lecture lorsque vous utilisez la chimie TruSeq v3. Utilisez ces renseignements lors de la configuration de
l'analyse.
Type d'analyse
Lecture unique, sans index
Lecture unique, index simple
Lecture unique, index double
Lecture appariée, sans index
Lecture appariée, index simple
Lecture appariée, Index double
¹ Nombre de cycles pour les librairies à index simple
² Nombre de cycles pour les librairies à index double
³ La lecture de l'index 2 d'une analyse appariée à index double comprend sept cycles supplémentaires uniquement chimiques
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
page 60.
Cycles de
Cycles de lecture
la lecture 1
de l'index 1 (i7)
≤ 101
--
≤ 101
6 ou 7 ¹
8 ²
≤ 101
8
≤ 101
--
≤ 101
7 ¹
8 ²
≤ 101
8
Cycles de lecture
Cycles de
de l'index 2 (i5)
la lecture 2
--
--
--
--
8
--
--
≤ 101
--
≤ 101
7 + 8 ³
≤ 101
30
31
32
35
39
43
46
46
50
50
Échelonner les
Nombre total
de cycles
≤ 101
≤ 108 ¹
≤ 109 ²
≤ 117
≤ 202
≤ 209 ¹
≤ 210 ²
≤ 225
30
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