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Guide du système HiSeq 2000
3
Saisissez un nom d'expérience qui apparaîtra sur chaque écran et permettra l'identification de l'analyse
en cours.
4
Saisissez un nom d'utilisateur, puis sélectionnez Next (Suivant).
Écran Advanced (Paramètres avancés)
1
[Facultatif]
Cochez la case Confirm First Base (Confirmer la première base).
Un rapport de la première base est automatiquement généré pour chaque analyse. Si vous cochez cette
option, le rapport de la première base s'ouvrira avant que l'analyse puisse poursuivre.
2
[Facultatif]
Décochez la case Align to PhiX (Aligner sur PhiX) pour chaque ligne ne contenant pas le
contrôle PhiX.
Vous pouvez également sélectionner les lignes de l'image de la Flow Cell pour ajouter ou supprimer des
lignes en vue d'un alignement PhiX.
Par défaut, toutes les lignes sont cochées pour que l'alignement soit fait.
REMARQUE
Avec les logiciels HCS v2.2 et RTA v1.18, vous n'avez pas besoin d'une ligne de contrôle dédiée; elle est
facultative.
3
[Facultatif]
Sélectionnez Keep Intensity Files (Conserver les fichiers d'intensité) pour une réanalyse
ultérieure ou un traitement personnalisé.
REMARQUE
Si cette option est sélectionnée, la taille du dossier de sortie des données augmente considérablement.
L'enregistrement des fichiers d'intensité n'est pas requis pour les analyses sur instrument.
4
Sélectionnez Next (Suivant).
Écran Recipe (Formule)
Une formule est générée automatiquement à partir des renseignements saisis à l'écran Recipe (Formule).
1
Choisissez parmi les options de type d'index suivantes :
No Index (Sans index) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée sans index.
u
Single Index (Index simple) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée avec une
u
seule lecture d'indexage.
Dual Index (Index double) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée avec deux
u
lectures d'indexage.
Custom (Personnalisé) : effectue une analyse à lecture unique ou à lecture appariée avec un nombre
u
personnalisé de cycles pour les lectures d'index.
2
Si l'option Dual Index (Index double) ou l'option Custom (Personnalisé) est choisie, sélectionnez un format
de Flow Cell, soit Single Read (À lecture unique) ou Paired End (Appariée).
3
Entrez le nombre de cycles pour la lecture 1 et la lecture 2, s'il y a lieu.
Chaque lecture comprend un cycle de plus que le nombre de cycles analysés. Par exemple, pour
effectuer 125 cycles pour la lecture 1, entrez 126.
4
Pour l'option d'indexage Custom (Personnalisé), saisissez le nombre de cycles pour les lectures d'index.
REMARQUE
Les longueurs de lecture peuvent ne pas être identiques.
Document nº 15011190 v02 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser dans le cadre d'examens diagnostiques.
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