Table des Matières
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Champs de l'écran Paramètres de Dissociation
Fenêtre Paramètres de dissociation
Tous les champs sont grisés pour les tests Extraction uniquement.
Longueur d'onde
Ce champ en lecture seule indique la longueur d'onde du canal, en nm.
Alias
Ce champ permet de définir une valeur personnalisée pour le canal. Cliquer dans le
champ afin de saisir une valeur pour l'alias, qui peut comporter jusqu'à 7 caractères
alphanumériques (par exemple, nom du colorant, organisme, etc.). Un seul alias peut être
attribué à chaque canal, qu'il soit activé pour la PCR et/ou la dissociation. L'alias remplace
le libellé de la longueur d'onde dans les écrans PCR, Dissociation et Quantification et
leurs rapports associés.
Gain dissociation
Le champ Gain dissociation permet de changer le niveau de puissance pour cette
longueur d'onde. Mettre en surbrillance la valeur affichée et saisir la valeur voulue (0–100)
ou cliquer sur le bouton « + » ou « - » pour augmenter ou diminuer (par incréments de 10)
la valeur d'amplification. La valeur par défaut est 0. Le Gain dissociation doit être
supérieur à 0 pour pouvoir enregistrer un test Dissociation uniquement.
Dès lors qu'une valeur Gain dissociation est attribuée à un canal, les champs Sens du pic,
Sensibilité et Zones de dissociation deviennent actifs.
Sens du pic
Le champ Sens du pic permet de configurer le sens prévu de la courbe de dissociation.
Le premier dérivé négatif de la variation de la fluorescence (-d(RFU)/dT) est représenté
graphiquement comme une fonction de température. Les technologies de détection les
plus courantes génèrent une diminution du signal de fluorescence car la température est
supérieure et les brins d'acide nucléique se séparent. Le premier dérivé négatif présente
un ou plusieurs pics distincts à la température de dissociation (Tm) de chaque produit
dans la réaction. La sélection du Sens du pic modifie le comportement de l'algorithme de
manière à indiquer les valeurs Tm finales.
•
Le réglage par défaut est Pic. Lorsque Pic est sélectionné comme Sens du pic, ces
valeurs de pic sont utilisées pour indiquer les valeurs Tm finales.
Si la technologie de détection provoque une augmentation du signal de fluorescence à
mesure que la température s'élève, les températures de dissociation sont représentées
par le tracé du premier dérivé négatif sous forme de pics inversés (ou creux).
•
Lorsque le Creux est sélectionné comme Sens du pic, ces valeurs de pic inversées
sont utilisées pour indiquer les valeurs Tm finales.
Sensibilité
Le champ Sensibilité permet de gérer la sensibilité de l'algorithme de dissociation.
La sensibilité peut être ajustée à l'aide de l'un des trois paramètres.
•
Profil de faible sensibilité : seuls les grands pics bien définis génèrent une valeur Tm
finale dans le résultat.
•
Profil de sensibilité normale : ce paramètre assure un équilibre entre la nécessité
d'intégrer les valeurs Tm issues de faibles variations et celle d'ignorer ces
modifications subtiles qui peuvent ne pas être liées à la dénaturation des acides
nucléiques.
5 – Références
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