Agilent Technologies SureScan G2600D Guide D'utilisation page 114

6 Références
Boîte de dialogue Scan Protocol Editor
Sensitivity (%)
Sensitivity (%)
XDR (Rapport
R E M A R Q U E
114
Red PMT Ce paramètre définit le niveau de sensibilité des PMT de la voie
rouge et de la voie verte. Les PMT détectent la fluorescence
et
émise par la puce à ADN.
Green PMT
Le niveau de sortie par défaut (100 %) règle le gain sur le niveau
défini en usine ; c'est le paramètre recommandé pour les puces
à ADN Agilent. Il est possible de baisser indépendamment le
réglage de chaque voie de couleur jusqu'à 1 %.
Si une puce à ADN renvoie un signal de sortie saturé, vous
pouvez ramener la sensibilité des PMT à une plage qui permette
de lire toutes les informations.
Avant la mise à disposition de la plage dynamique TIFF 20 bits,
XDR)
on utilisait la fonction eXtended Dynamic Range (XDR) sur le
scanner et sur le programme Feature Extraction, afin de
capturer toutes les données numérisées entre les motifs à signal
très faible et les motifs à signal très fort. Pour capturer toute la
plage dynamique des données, il est désormais possible
d'utiliser le mode TIFF 20 bits au lieu de la fonction XDR.
Si l'option 20 bits est sélectionnée, aucune option XDR n'est autorisée.
Lorsque la fonction XDR est active, le scanner numérise chaque
diapositive deux fois, avec des niveaux de sensibilité de PMT
différents. On obtient ainsi deux images liées, que le logiciel
Feature Extraction analyse ensemble pour créer un seul jeu de
données d'intensité. Ces données vont du simple au millionième
et au-delà.
Le gain du PMT rouge ou vert définit le niveau de sensibilité
supérieur. La fonction XDR est automatiquement désactivée
aux valeurs inférieures à 10 %.
Lorsqu'un rapport XDR est défini, le scanner effectue une
deuxième numérisation avec des paramètres de PMT plus bas.
Par exemple, si les PMT rouge et vert sont réglés sur 100 %, et
que le rapport XDR est réglé sur 0,1, la deuxième numérisation
est effectuée avec un réglage de 10 % pour les PMT. Les valeurs
disponibles sont : <NoXDR>, 0.5, 0.2, 0.1 et 0.05.
Guide d'utilisation du système SureScan