Publicité
Documentation produit NovaSeq 6000Dx
Présentation du séquençage
Le séquençage sur le NovaSeq 6000Dx comprend la génération d'amplifiats, le séquençage et la
définition de base. Chaque étape se produit automatiquement lors d'une analyse de séquençage. Une
analyse secondaire est ensuite effectuée sur le Serveur Illumina DRAGEN pour NovaSeq 6000Dx
lorsque l'analyse est terminée.
Génération d'amplifiats
Durant la génération d'amplifiats, les molécules d'ADN uniques sont ensuite liées à la surface de la Flow
Cell, puis amplifiées simultanément de façon à former des amplifiats.
Séquençage
L'imagerie des amplifiats est réalisée par chimie de séquençage à deux canaux, un canal vert et un
canal rouge, pour coder les données des quatre nucléotides. La Flow Cell est balayée en plusieurs
passages et chaque balayage est analysé sous forme de plaques imagées individuellement. Ce
processus se répète pour chaque cycle de séquençage.
Analyse primaire
Au cours de l'analyse de séquençage, le logiciel Real-Time Analysis (RTA3) réalise définition des
1
bases
le filtrage et la notation de la qualité.
contrôle transfère automatiquement les fichiers de définition de base concaténés
dossier de sortie spécifié pour l'analyse des données.
Analyse secondaire
Lorsque le séquençage et l'analyse primaire sont terminés, l'analyse secondaire commence. La
méthode d'analyse des données secondaires dépend de la configuration de votre application et de
votre système. Diverses options d'analyse secondaire sont disponibles pour les types d'analyse RUO et
IVD. Si une analyse de séquençage est créée à l'aide d'une application Illumina Run Manager qui utilise
le Serveur Illumina DRAGEN pour NovaSeq 6000Dx pour effectuer une analyse secondaire, les données
de séquençage sont envoyées au serveur pour analyse à l'aide de l'application d'analyse sélectionnée
lors de la configuration de l'analyse.
1
Détermine une base (A, C, G ou T) pour chaque amplifiat d'une plaque donnée d'un cycle spécifique.
2
Calcule un ensemble d'indicateurs prévisionnels pour chaque définition des bases, puis utilise cette valeur pour
rechercher un score de qualité.
3
Contient la définition de base et le score de qualité associé pour chaque amplifiat de chaque cycle de
séquençage.
Document n° 200010105 v02
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
2
Au fur et à mesure que l'analyse progresse, le logiciel de
3
(*.cbcl) vers le
3
Publicité
