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illumina NovaSeq 6000Dx Documentation page 74

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Documentation produit NovaSeq 6000Dx
Figure 24 Simplification du score de la qualité avec RTA3
Fichiers de sortie de séquençage
Type de fichiers
Fichiers de définition
des bases
Fichiers
d'emplacement des
amplifiats
Fichiers de filtrage
Document n° 200010105 v02
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
Description, emplacement et nom des fichiers
Chaque amplifiat analysé est compris dans un fichier de définition des bases ;
ces fichiers sont rassemblés dans un fichier pour chaque cycle, chaque ligne
et chaque surface. Le fichier rassemblé contient la définition des bases ainsi
que le score de qualité codé associé à chaque amplifiat.
Data\Intensities\BaseCalls\L001\C1.1
L[lane]_[surface].cbcl, par exemple L001_1.cbcl
Pour chaque Flow Cell, un fichier d'emplacement des amplifiats binaire
comprend les coordonnées XY des amplifiats sur la plaque. Une disposition
hexagonale qui concorde avec l'emplacement des nanopuits de la Flow Cell
prédéfinit les coordonnées.
Data\Intensities
s_[lane].locs
Le fichier de filtrage spécifie si un amplifiat a franchi les filtres. Les fichiers de
filtrage sont générés au cycle 26 et portent sur 25 cycles de données. Un
fichier de filtrage est généré pour chaque plaque.
Data\Intensities\BaseCalls\L001
s_[lane]_[tile].filter
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