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Documentation produit NovaSeq 6000Dx
Type de fichiers
Fichier de
renseignements sur
l'analyse
Fichiers des
miniatures
Structure des dossiers de sortie de séquençage
Le NVOS génère automatiquement le nom du dossier de sortie.
Config : paramètres de configuration de l'analyse.
Logs : fichiers journaux décrivant les étapes de fonctionnement, les étapes des analyses sur
l'instrument et les évènements de RTA3.
SampleSheet.csv : feuille d'échantillon ou autre fichier joint, le cas échéant.
Data (Données)
Intensities (Intensités)
BaseCalls (Définitions de bases)
L00[X] : fichiers de définition des bases (*.cbcl), rassemblés dans un fichier par ligne,
par surface et par cycle.
s.locs : fichier d'emplacement des amplifiats de l'analyse.
InterOp : fichiers binaires.
Recipe (Formule) : fichier de formule propre à l'analyse.
Thumbnail Images (Images miniatures) : images miniatures générées après chaque tranche de
10 plaques.
LIMS : fichier de configuration (*.json), s'il y a lieu.
Audit
AuditInfo.xml
RTA3.cfg
RunInfo.xml
RunParameters.xml
RTAComplete.txt
Document n° 200010105 v02
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
Description, emplacement et nom des fichiers
Indique le nom de l'analyse, le nombre de cycles à chaque lecture, si la lecture
est une lecture d'index et le nombre de témoins et de plaques sur la Flow Cell.
Le fichier de renseignements sur l'analyse est créé au début de l'analyse.
[Root folder], RunInfo.xml
Images de miniatures du premier cycle de chaque séquençage.
Thumbnail_Images\L001\C[X.1] : les fichiers sont stockés dans un sous-
dossier pour chaque cycle.
s_[lane]_[tile]_[channel].jpg : l'image miniature comprend le numéro
de la plaque.
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