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Documentation produit NovaSeq 6000Dx
Sortie de séquençage
Lors du séquençage, les données sont automatiquement transférées de Instrument NovaSeq 6000Dx
vers le Serveur DRAGEN. Lorsque l'analyse primaire et le transfert des données sont terminés, l'analyse
secondaire sur le Serveur DRAGEN peut commencer automatiquement à l'aide des options d'analyse
définies par l'application sélectionnée dans Illumina Run Manager. Les résultats produits dépendent des
options choisies lors de la configuration de l'analyse. Pour afficher les résultats d'une analyse,
sélectionnez le nom de l'analyse souhaitée dans l'onglet Completed (Terminé) de l'écran Runs
(Analyses). Vous pouvez également trouver des fichiers de sortie à l'emplacement spécifié sur l'écran
Instrument Settings (Paramètres de l'instrument).
Real-Time Analysis
Le Instrument NovaSeq 6000Dx exécute RTA3, une version du logiciel Real-Time Analysis, à partir de
son propre moteur de calcul (CE ou Compute Engine). RTA3 extrait les intensités des images reçues de
la caméra, effectue les définitions des bases, associe un score de qualité à chaque définition des bases,
effectue l'alignement à PhiX et élabore les rapports dans les fichiers InterOp.
Pour optimiser le délai de traitement, RTA3 conserve les données en mémoire. Si RTA3 est arrêté, le
traitement ne reprend pas et les données de l'analyse en cours de traitement dans la mémoire sont
perdues.
Entrées dans RTA3
RTA3 nécessite les images des plaques contenues dans la mémoire locale du système aux fins du
traitement. RTA3 reçoit l'information sur l'analyse et des commandes de NVOS.
Sorties RTA3
Les images de chaque canal de couleur passent de la mémoire à RTA3 sous forme de plaques. À l'aide
de ces images, RTA3 produit un ensemble de fichiers de filtrage et de fichiers de définition des bases
dont la qualité est notée. Toutes les autres données de sortie sont des données complémentaires des
principaux fichiers de sortie.
Type de fichiers
Fichiers de définition
des bases
Fichiers de filtrage
Document n° 200010105 v02
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
Description
Chaque plaque analysée est incluse dans un fichier de définition des
bases concaténé (*.cbcl). Les plaques de la même ligne et de la même
surface sont rassemblées dans un fichier CBCL pour chacune des lignes
et des surfaces.
Chaque plaque produit un fichier de filtrage (*.filter) qui précise si un
amplifiat a franchi les filtres.
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