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Documentation produit NovaSeq 6000Dx
Figure 23 Visualisation de l'intensité des amplifiats
Tableau 19
Définition des bases dans le séquençage à deux canaux
Canal
Base
rouge
A
1 (allumé)
C
1 (allumé)
G
0 (éteint)
T
0 (éteint)
Amplifiats passant le filtre
Au cours de l'analyse, RTA3 filtre les données brutes pour supprimer les lectures non conformes au
seuil de qualité des données. Les amplifiats qui se chevauchent et ceux de mauvaise qualité sont
supprimés.
Dans le cas d'une analyse sur deux canaux, RTA3 utilise un système basé sur une population pour
déterminer la pureté (mesure de la pureté de l'intensité) d'une définition des bases Les amplifiats
franchissent le filtre (PF) lorsqu'une définition des bases ou moins, au cours des 25 premiers cycles, a
une pureté inférieure à un seuil déterminé. L'alignement PhiX est réalisé au cycle 26 dans un sous-
ensemble de plaques pour les amplifiats ayant passé le filtre. Les amplifiats qui ne passent pas le filtre
ne servent pas à la définition des bases et ne sont pas alignés.
Document n° 200010105 v02
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
Canal vert
Résultats
1 (allumé)
Amplifiats montrant une intensité tant dans le canal
rouge que dans le canal vert.
0 (éteint)
Amplifiats montrant une intensité seulement dans
le canal rouge.
0 (éteint)
Amplifiats ne montrant d'intensité dans aucun
emplacement d'amplifiat connu.
1 (allumé)
Amplifiats montrant une intensité seulement dans
le canal vert.
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