Instruments - Qiagen Rotor-Gene Q MDx CE Manuel D'utilisation

Elle peut aussi être utilisée dans des applications d'épigénétique pour la détection et l'analyse de
la méthylation de l'ADN. Elle peut également permettre la détection quantitative d'une petite
quantité d'ADN variant dans un bruit de fond de séquence de type sauvage à des sensibilités
proches de 5 %. Cela peut permettre, par exemple, d'étudier les mutations ou variations somatiques
dans la méthylation des îlots CpG.
La HRM sur le Rotor-Gene Q MDx facilite de nombreuses applications, notamment :
Identification des gènes candidats de prédisposition

Études d'association (comparant des cas et des contrôles, du génotype au phénotype)

Détermination de la prévalence allélique au sein d'une population ou d'un sous-groupe

Dépistage et validation des SNP

Dépistage d'une perte d'hétérozygosité

Profilage génétique

Caractérisation de blocs d'haplotypes

Analyse de méthylation de l'ADN

Cartographie génétique

Identification d'espèces

Découverte de mutation

Détermination du taux de mutations somatiques

Typage HLA

La HRM est plus facile et plus rentable que les dosages de génotypage avec sonde et, contrairement
aux méthodes conventionnelles, il s'agit d'un système à tubes fermés qui empêche toute
contamination par les produits de PCR. Les résultats sont comparables aux méthodes
conventionnelles de type polymorphisme de conformation des ADN simples brins (Single strand
conformation polymorphism, SSCP), chromatographie liquide haute performance sur gel dénaturant
(Denaturing high performance liquid chromatography, DHPLC), polymorphisme de restriction
(Restriction fragment length polymorphism, RFLP) et séquençage d'ADN.

10.1 Instruments

Voici les fonctions thermo-optiques en temps réel de pointe, requises pour la HRM, du
Rotor-Gene Q MDx.
Illumination haute intensité

Détection optique haute sensibilité

Manuel d'utilisation du Rotor Gene Q MDx CE 02/2022 172