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6.6.8
Analyse du graphique de dispersion
L'analyse du graphique de dispersion permet le génotypage d'après l'expression relative des tracés
d'amplification sur 2 canaux. Contrairement à la discrimination allélique, le génotype est déterminé
d'après des régions définies à partir du graphique de dispersion et pas à partir d'un simple seuil.
Pour réaliser cette analyse, sélectionnez Other (Autre) puis Scatter Graph Analysis (Analyse du
graphique de dispersion) dans la fenêtre Analysis (Analyse).
Lorsque vous faites une analyse du graphique de dispersion, il ne suffit pas de double-cliquer sur
un canal à analyser, car cette analyse s'effectue sur 2 canaux à la fois. Pour réaliser cette analyse,
maintenez la touche Maj enfoncée et cliquez sur les canaux à analyser ou faites glisser le pointeur
de la souris sur les canaux. Une fois les canaux souhaités mis en surbrillance, cliquez sur Show
(Afficher).
La liste est actualisée pour afficher tous les canaux sur une ligne, chacun étant coché. Cela indique
qu'ils seront tous utilisés dans une même analyse. Pour supprimer un ou plusieurs de ces canaux,
faites un clic droit sur l'analyse puis sélectionnez Remove Analysis... (Supprimer l'analyse...). Ces
canaux peuvent ensuite être intégrés à une autre analyse du graphique de dispersion. Un canal ne
peut être utilisé que dans une seule analyse à la fois.
Reports (Rapports) :
Permet d'ouvrir le rapport Scatter Analysis (Analyse de dispersion) à visualiser.
Results (Résultats) :
Permet d'afficher la fenêtre Scatter Analysis Results (Résultats de l'analyse de
dispersion). Cette fenêtre est ouverte par défaut lors du premier affichage de
l'analyse.
Options de normalisation :
Diverses options sont disponibles pour optimiser la normalisation des données
brutes :
Pour plus de détails, consultez la page 95.
Genotypes (Génotypes) :
Permet d'ouvrir la fenêtre Genotyping (Génotypage) qui permet de définir le
génotype détecté sur chaque canal. Dans cette fenêtre, l'affectation des
génotypes est possible selon les canaux sur lesquels réagit un échantillon. Les
canaux sélectionnés seront utilisés pour marquer les angles du graphique de
dispersion et guideront l'utilisateur vers la zone générale du graphique dans
laquelle les régions doivent être définies.
Manuel d'utilisation du Rotor Gene Q MDx CE 02/2022
•
Dynamic Tube (Tube dynamique) (Normalisation du tube dynamique)
•
Slope Correct (Correction de la pente) (Correction de la pente du bruit)
•
Ignore First x cycles (Ignorer les x premiers cycles) (Correction du
bruit dans les cycles initiaux)
•
Ajustement du point de hausse
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